Nombre de revista Journal of Applied Physiology

Año de publicación 2018

Número ND

Volumen 125

Página pagina

Autorización No

Proyecto 369

Los perezosos son habitantes de las copas de los árboles. Selvas tropicales neotropicales americanas que exhiben comportamientos suspensorios. Estas habilidades requieren fuerza y ​​resistencia muscular para mantenerse durante largos períodos de tiempo; sin embargo, la masa del músculo esquelético de los perezosos se reduce, por lo que se requieren modificaciones en la arquitectura muscular y el apalancamiento para un gran torque articular. Presumimos que las propiedades musculares intrínsecas también se modifican para la resistencia a la fatiga y predecir una expresión heterogénea de fibras de cadena pesada de miosina lenta / rápida (MHC) que utilizan vías metabólicas oxidativas para la producción de fuerza económica. La distribución del tipo de fibra MHC y el metabolismo energético en los músculos de las extremidades anteriores de perezosos de tres dedos (Bradypus variegatus, n 5) y dos dedos (Choloepus hoffmanni, n 4) se evaluaron utilizando SDS-PAGE, inmunohistoquímica y ensayos de actividad enzimática. Los resultados apoyan parcialmente nuestra hipótesis por una expresión primaria de la isoforma lenta MHC-1 así como una expresión moderada de fibras rápidas MHC-2A, mientras que se encontraron pocas fibras híbridas MHC-1 / 2A en ambas especies. Las fibras MHC-1 eran más grandes en área de sección transversal (CSA) que las fibras MHC-2A y comprendían el mayor porcentaje de CSA en cada músculo muestreado. Los ensayos enzimáticos mostraron una actividad elevada para las enzimas anaeróbicas creatina quinasa y lactato deshidrogenasa en comparación con una baja actividad para los marcadores aeróbicos citrato sintasa y 3-hidroxiacetil CoA deshidrogenasa. Estos hallazgos sugieren que los músculos de las extremidades anteriores de los perezosos pueden depender en gran medida de las vías rápidas de resíntesis de ATP, y la acumulación de lactato puede ser beneficiosa. Las propiedades intrínsecas observadas coinciden bien con los requisitos de suspensión, y estas modificaciones pueden haber evolucionado aún más al unísono con un metabolismo bajo y patrones de movimiento lentos como medio para sistémicamente conserva energía.

Palabras Clave

arbóreo metabolismo músculo cadena pesada de miosina suspensión

Sloths are canopy-dwelling inhabitants of American neotropical rainforests that exhibit suspensory behaviors. These abilities require both strength and muscular endurance to hang for extended periods of time; however, the skeletal muscle mass of sloths is reduced, thus requiring modifications to muscle architecture and leverage for large joint torque. We hypothesize that intrinsic muscle properties are also modified for fatigue resistance and predict a heterogeneous expression of slow/fast myosin heavy chain (MHC) fibers that utilize oxidative metabolic pathways for economic force production. MHC fiber type distribution and energy metabolism in the forelimb muscles of three-toed (Bradypus variegatus, n 5) and two-toed (Choloepus hoffmanni, n 4) sloths were evaluated using SDS-PAGE, immunohistochemistry, and enzyme activity assays. The results partially support our hypothesis by a primary expression of the slow MHC-1 isoform as well as moderate expression of fast MHC-2A fibers, whereas few hybrid MHC-1/2A fibers were found in both species. MHC-1 fibers were larger in cross-sectional area (CSA) than MHC-2A fibers and comprised the greatest percentage of CSA in each muscle sampled. Enzyme assays showed elevated activity for the anaerobic enzymes creatine kinase and lactate dehydrogenase compared with low activity for aerobic markers citrate synthase and 3-hydroxyacetyl CoA dehydrogenase. These findings suggest that sloth forelimb muscles may rely heavily on rapid ATP resynthesis pathways, and lactate accumulation may be beneficial. The intrinsic properties observed match well with suspensory requirements, and these modifications may have further evolved in unison with low metabolism and slow movement patterns as means to systemically conserve energy.

Keywords

arboreal metabolism muscle myosin heavy chain suspension

Nombre de revista Journal of Experimental Biology

Año de publicación 2020

Número 14

Volumen 223

Página pagina

Autorización No

Proyecto 369

Los perezosos exhiben una locomoción debajo de las ramas por lo que sus extremidades se cargan en tensión para soportar el peso corporal. Los comportamientos suspensorios requieren fuerza y ​​resistencia a la fatiga de los flexores de las extremidades; sin embargo, la masa del músculo esquelético de los perezosos se reduce en comparación con otros mamíferos arbóreos. Aunque la locomoción suspensiva exige. Si los músculos están activos para contrarrestar el tirón de la gravedad, es posible que los perezosos minimicen la activación muscular y / o recluten selectivamente unidades motoras lentas para mantener el apoyo, lo que indica especializaciones neuromusculares para conservar energía. La electromiografía (EMG) fue evaluados en una muestra de perezosos de tres dedos (Bradypus variegatus; N = 6) para probar esta hipótesis. La EMG se registró a 2000 Hz mediante electrodos de alambre fino implantados en dos conjuntos de cuatro músculos de la extremidad anterior izquierda, mientras que los perezosos realizaban suspensión en suspensión (SH), caminata en suspensión (SW) y escalada vertical (VC). Todos los músculos estaban mínimamente activos para SH. Durante SW y VC, los perezosos se movían lentamente (factor de trabajo: 0,83) y los patrones de activación fueron consistentes entre los comportamientos; los flexores se activaron temprano y en un gran porcentaje de contacto con las extremidades, mientras que los extensores se activaron para duraciones de ráfagas más cortas en promedio y mostraron actividad bifásica (contacto y balanceo). Las actividades musculares fueron máximas para los flexores del codo y más bajas para los flexores carpianos / digitales, y la actividad general fue significativamente mayor para SW y VC en comparación con SH. El análisis de ondículas indicó frecuencias EMG medias altas de los espectros de intensidad mioeléctrica junto con intensidades de ráfagas bajas para SH, aunque ocurrió el patrón opuesto para SW y VC, con los flexores del hombro y el flexor del codo, m. brachioradialis, que tiene frecuencias EMG medias extremadamente bajas que son consistentes con el reclutamiento de fibras lentas. Colectivamente, estos Los hallazgos apoyan la hipótesis y sugieren que los perezosos pueden reclutar selectivamente unidades motoras más pequeñas y rápidas para posturas de suspensión, pero tienen la capacidad de compensar el costo de la producción de fuerza mediante el reclutamiento de unidades motoras grandes y lentas durante la locomoción.

Palabras Clave

Flexor Motor units Muscle Suspension

Sloths exhibit below branch locomotion whereby their limbs are loaded in tension to support the body weight. Suspensory behaviors require both strength and fatigue resistance from the limb flexors; however, skeletal muscle mass of sloths is reduced compared with other arboreal mammals. Although suspensory locomotion demands that muscles are active to counteract the pull of gravity, it is possible that sloths minimize muscle activation and/or selectively recruit slow motor units to maintain support, thus indicating neuromuscular specializations to conserve energy. Electromyography (EMG) was evaluated in a sample of three-toed sloths (Bradypus variegatus; N=6) to test this hypothesis. EMG was recorded at 2000 Hz via finewire electrodes implanted into two suites of four muscles in the left forelimb while sloths performed suspensory hanging (SH), suspensory walking (SW) and vertical climbing (VC). All muscles were minimally active for SH. During SW and VC, sloths moved slowly (duty factor: 0.83) and activation patterns were consistent between behaviors; the flexors were activated early and for a large percentage of limb contact, whereas the extensors were activated for shorter burst durations on average and showed biphasic (contact and swing) activity. Muscle activities were maximal for the elbow flexors and lowest for the carpal/digital flexors, and overall activity was significantly greater for SW and VC compared with SH. Wavelet analysis indicated high mean EMG frequencies from the myoelectric intensity spectra coupled with low burst intensities for SH, although the opposite pattern occurred for SW and VC, with the shoulder flexors and elbow flexor, m. brachioradialis, having extremely low mean EMG frequencies that are consistent with recruitment of slow fibers. Collectively, these findings support the hypothesis and suggest that sloths may selectively recruit smaller, fast motor units for suspensory postures but have the ability to offset the cost of force production by recruitment of large, slow motor units during locomotion.

Keywords

Flexor unidades motoras músculo suspensión

Nombre de revista Biología Tropical

Año de publicación 2020

Número 1

Volumen 68

Página pagina

Autorización No

Proyecto 360

Introducción: Los pequeños invertebrados terrestres se dispersan de manera pasiva a través de las corrientes de viento, formando lo que se conoce como plancton aéreo, el cual aún no ha sido relevado para el Pacífico Tropical Oriental. La documentación del plancton aéreo de Isla del Coco permitirá comprender mejor el proceso de colonización de esta isla tan diversa. Objetivo: Caracterizar el plancton aéreo presente en el transecto Puntarenas - Isla del Coco. Métodos: Las muestras se recolectaron mediante redes entomológicas en 2 viajes de ida y vuelta durante los meses de julio y agosto de 2017 y 2018, respectivamente. Resultados: Se recolectaron un total de 10 morfoespecies correspondientes a los órdenes: Diptera (Ceratopogonidae, Milichiidae y Nematocera de una familia no identificada), Hymenoptera (Chalcidoidea: Agaonidae), Hemiptera (Scutelleridae y Coreidae) y Lepidoptera (Sphingidae). . Se recolectaron dípteros e himenópteros en las redes; mientras, Hemiptera y Lepidoptera se encontraron en la cubierta del barco. No se recolectaron arañas. Las familias Diptera e Hymenoptera, así como la familia Coreidae (Hemiptera), se han registrado previamente en este tipo de prospecciones en el Pacífico tropical. Conclusiones: Dos de los taxones recolectados por redes, Ceratopogonidae (Diptera) y Chalcidoidea (Hymenoptera), tienen representantes en la Isla del Coco, lo que podría brindar apoyo directo a la dispersión del viento como mecanismo de colonización de estos grupos. También detectamos otros insectos (es decir, Lepidoptera y Scutelleridae-Hemiptera) que muy probablemente llegaron al barco por sus propios medios proporcionando evidencia de sus habilidades de dispersión. Esta investigación proporciona datos para ampliar aún más las preguntas sobre los mecanismos de colonización de islas.

Palabras Clave

Dispersión a larga distancia Plancton aéreo Artrópodos Pacífico Tropical Oriental Isla del Coco

Introduction: Small terrestrial invertebrates disperse in a passive manner through wind currents, forming what is known as aerial plankton, which has not been surveyed yet for the Eastern Tropical Pacific. Documenting the aerial plankton of Isla del Coco will allow to better understand the colonization process of this highly diverse island. Objective: Characterize the aerial plankton present on the transect Puntarenas – Isla del Coco. Methods: Specimens were collected using entomological nets on 2 roundtrip voyages during the months of July and August of 2017 and 2018, respectively. Results: A total of 10 morpho-species were collected corresponding to the orders: Diptera (Ceratopogonidae, Milichiidae, and Nematocera of a non-identified family), Hymenoptera (Chalcidoidea: Agaonidae), Hemiptera (Scutelleridae and Coreidae) and Lepidoptera (Sphingidae). Diptera and Hymenoptera were collected on the nets; while, Hemiptera and Lepidoptera were found on the deck of the boat. No spiders were collected. The Diptera and Hymenoptera families, as well as the family Coreidae (Hemiptera), have been previously recorded on this type of surveys across the tropical Pacific. Conclusions: Two of the taxa collected by nets, Ceratopogonidae (Diptera) and Chalcidoidea (Hymenoptera), have representatives on Isla del Coco, which could provide direct support for wind dispersal as a colonization mechanism for these groups. We also detected other insects (i.e. Lepidoptera and Scutelleridae-Hemiptera) which most likely reached the boat by their own means providing evidence of their dispersal abilities. This research provides data to further expand on questions about the mechanisms of island colonization.

Keywords

Long-distance dispersal Aerial plankton Arthropods Eastern Tropical Pacific Isla del Coco

Nombre de revista Animal Behaviour

Año de publicación 2016

Número ND

Volumen 116

Página pagina

Autorización No

Proyecto 284

La capacidad de reconocer a los parientes tiene un impacto importante en la aptitud porque puede permitir comportamientos afiliativos sesgados por los parientes y evitar el apareamiento con parientes cercanos. Si bien la presencia y los efectos de los sesgos de parentesco Se han estudiado ampliamente, se sabe menos sobre el proceso por el cual los animales reconocen a los parientes cercanos. Aquí nosotros Investigar pistas potenciales que los monos capuchinos de cara blanca, Cebus capucinus, pueden usar para detectar la mitad hermanos y parientes más cercanos. Nos centramos en el primer año de vida en una muestra de 130 lactantes (N ¼ 65 lactantes hembras) capuchinos salvajes de la población de Lomas Barbudal en Costa Rica. Mostramos que (1) la relación infantil con Los machos jóvenes y adultos en el nivel de medio hermano y superior pueden predecirse por el estado alfa del macho, proximidad espacial y proximidad de edad, y que (2) la relación del niño con las hembras jóvenes y adultas en el El nivel de medio hermano o superior puede predecirse por proximidad espacial (pero no por proximidad de edad). Además, (1) las identidades de los padres de los bebés también pueden predecirse por el estado alfa masculino y la proximidad espacial entre bebés y varones adultos, y (2) la proximidad de la edad (pero no la proximidad espacial) es predictiva de hermandad paterna. Estos resultados sugieren que los bebés capuchinos tienen acceso a múltiples señales para cerrar parentesco y parentesco paterno, aunque queda por determinar si los bebés usan estas señales más adelante en la vida. explorado en investigaciones futuras

Palabras Clave

proximidad de edad capucho familiaridad social temprana reconocimiento de parentesco dominio masculino

The ability to recognize kin has important impacts on fitness because it can allow for kin-biased affiliative behaviours and avoidance of mating with close kin. While the presence and effects of kin biases have been widely studied, less is known about the process by which animals recognize close kin. Here we investigate potential cues that white-faced capuchin monkeys, Cebus capucinus, may use to detect half siblings and closer kin. We focus on the first year of life in a sample of 130 infant (N ¼ 65 infant females) wild capuchins from the Lomas Barbudal population in Costa Rica. We show that (1) infant relatedness to juvenile and adult males at the level of half sibling and higher can be predicted by male alpha status, spatial proximity and age proximity, and that (2) infant relatedness to juvenile and adult females at the level of half sibling or higher can be predicted by spatial proximity (but not age proximity). Furthermore, (1) the identities of infants' fathers can also be predicted by male alpha status and the spatial proximity between infants and adult males, and (2) age proximity (but not spatial proximity) is predictive of paternal sibship. These results suggest that infant capuchins have access to multiple cues to close relatedness and paternal kinship, although whether infants use these cues later in life remains to be explored in future research.

Keywords

age proximity capuchin early social familiarity kin recognition male dominance

Nombre de revista Behaviour

Año de publicación 2017

Número 2

Volumen 154

Página pagina

Autorización No

Proyecto 284

Es raro en los estudios de animales longevos conocer lo suficiente sobre las personalidades y las experiencias tempranas de los individuos para usar esta información para predecir su comportamiento durante las transiciones importantes de la vida en la adolescencia y la edad adulta. Aquí, examinamos cómo los rasgos de personalidad y las experiencias tempranas predicen la edad de la emigración natal y el momento del primer ascenso al estado alfa en 169 machos salvajes de cara blanca. Capuchinos estudiaron en Lomas Barbudal, Costa Rica, 75 de los cuales emigraron y 23 de los cuales adquirieron estado alfa. Los varones eran más propensos a retrasar la emigración natal si eran más extrovertidos, más neuróticos, si sus padres convivían más tiempo con ellos, y si había menos pérdidas de balón de machos alfa. Los machos más extravertidos alcanzaron el estado alfa antes.

Palabras Clave

historias de vida masculinas personalidad dispersión rango de dominación capuchinos

It is rare in studies of long-lived animals to know enough about the personalities and early experiences of individuals to use this information to predict their behaviour during major life transitions in adolescence and adulthood. Here, we examine how personality traits and early experiences predict age of natal emigration and timing of first ascent to alpha status in 169 wild male white-faced capuchins studied at Lomas Barbudal, Costa Rica, 75 of whom emigrated and 23 of whom acquired alpha status. Males were more likely to delay natal emigration if they were more extraverted, more neurotic, if their fathers co-resided longer with them, and if there were fewer alpha male turnovers. More extraverted males attained alpha status sooner.

Keywords

male life histories personality dispersal dominance rank capuchins

Nombre de revista Zootaxa

Año de publicación 2019

Número 2

Volumen 4608

Página pagina

Autorización No

Proyecto 543

Describimos la nueva especie Norops arenal sp. nov. del Parque Nacional Volcán Arenal, centro-norte de Costa Rica. En morfología externa y similitud genética del código de barras de ADN 16S, Norops arenal es más similar a N. altae, N. fortunensis, N. fuscoauratus, N. gruuo, N. kemptoni, N. monteverde, N. pseudokemptoni y N. tenorioensis. En morfología comparte con estas especies las siguientes características: (1) miembros posteriores cortos; (2) un solo prenasal alargado escala; (3) escamas corporales diminutas, lisas, a menudo yuxtapuestas; y (4) un habitus delgado, a menudo delicado. Norops arenal se diferencia de estas especies, entre varios detalles de escala, por tener un área central negruzca en la papada masculina en vida y en conservante (frente a la ausencia de pigmento negro en la papada masculina en las otras especies), y una pequeña papada roja femenina en vida (vs. blanco sucio, color crema o naranja); patas traseras extremadamente cortas con la punta del cuarto dedo de la pata trasera adpresa llegando solo al nivel del hombro (vs. usualmente al menos al nivel de la oreja en las otras especies); una cola corta con una longitud de cola / SVL proporción de 1,53 en un solo espécimen con cola completa (frente a esta proporción> 1,6 en las otras especies); y un tamaño minúsculo con 41,5 mm en un solo varón adulto conocido y 38,5 mm en una única hembra adulta conocida (frente a la LSE de los adultos generalmente> 42,0 mm). Es más se diferencia de N. altae, N. fuscoauratus, N. gruuo, N. pseudokemptoni y N. tenorioensis por tener un hemipene unilobulado (vs. bilobulado en estas cinco especies).

Palabras Clave

Código de barras de ADN morfología del hemipenis Baja Centroamérica anoles continentales Norops arenal Norops carpenteri taxonomía ecomorfo ramita anole 16S

We describe the new species Norops arenal sp. nov. from Parque Nacional Volcán Arenal, north-central Costa Rica. In external morphology and genetic similarity of the 16S DNA barcode, Norops arenal is most similar to N. altae, N. fortunensis, N. fuscoauratus, N. gruuo, N. kemptoni, N. monteverde, N. pseudokemptoni, and N. tenorioensis. In morphology it shares with these species the following characteristics: (1) short hind limbs; (2) a single elongate prenasal scale; (3) tiny, smooth, often juxtaposed body scales; and (4) a slender habitus, often delicate. Norops arenal differs from these species, among several scalation details, by having a blackish central area in the male dewlap in life and in preservative (vs. no suffusion of black pigment on male dewlap in the other species), and a small red female dewlap in life (vs. dirty white, cream colored, or orange); extremely short hind legs with the tip of fourth toe of the adpressed hind leg reaching only to level of shoulder (vs. usually at least to level of ear in the other species); a short tail with a tail length/SVL ratio of 1.53 in single specimen with complete tail (vs. this ratio >1.6 in the other species); and a tiny size with 41.5 mm in single known adult male and 38.5 mm in single known adult female (vs. SVL of adults usually >42.0 mm). It further differs from N. altae, N. fuscoauratus, N. gruuo, N. pseudokemptoni, and N. tenorioensis by having a unilobed hemipenis (vs. bilobed in these five species).

Keywords

DNA barcoding hemipenis morphology Lower Central America mainland anoles Norops arenal Norops carpenteri taxonomy twig anole ecomorph 16S

Nombre de revista Acta Biológica Colombiana

Año de publicación 2018

Número 2

Volumen 23

Página pagina

Autorización No

Proyecto 573

Las microalgas componen un diverso grupo polifilético de microorganismos fotosintéticos. Debido a su potencial biotecnológico, los estudios para aislar e identificar nuevas cepas han incrementado, por lo que es necesario el desarrollo de nuevas técnicas para su correcta identificación y clasificación. Utilizando herramientas de biología molecular, en este estudio se analizó el gen del ADNr 18S de 12 cepas microalgales aisladas de diferentes regiones de Costa Rica, resultando seis pertenecientes a la clase Trebouxiophyceae, tres a Chlorophyceae, dos a Prymnesiophyceae y una a Cyanidiophyceae. Este estudio reporta por primera vez la identificación molecular de cepas microalgales aisladas de Costa Rica, resaltando la diversidad de estos microorganismos en el país.

Palabras Clave

biotecnología microalgal filogenia identificación molecular

Microalgae integrate a diverse polyphyletic group of photosynthetic microorganisms. Due to its biotechnological potential, studies to isolate and identify new strains have increased, hence, it is necessary to develop new techniques for their correct identification and classification. Using molecular biology tools, this study analyzed the 18S rDNA gene from 12 microalgal strains isolated from different regions of Costa Rica, resulting in six strains belonging to the class Trebouxiophyceae, three to Chlorophyceae, two to Prymnesiophyceae and one to Cyanidiophyceae. This study reports for the first time the molecular identification of microalgal strains isolated from Costa Rica, highlighting the diversity of these microorganisms in the country

Keywords

microalgal biotechnology molecular identification phylogeny

Nombre de revista Tecnología en marcha

Año de publicación 2019

Número 9

Volumen 32

Página pagina

Autorización No

Proyecto 580

La biotecnología microalgal se presenta como una oportunidad de mercado para el sector productivo costarricense. En esta revisión se detallarán algunos aspectos de los potenciales y limitaciones que tiene este sector de la biotecnología para nuestra región. La visualización de este potencial se remonta a más de una década, en donde en el Centro de Investigación en Biotecnología se dio inicio con el proceso de selección y conservación de cepas de microalgas nativas y su escalamiento. Se describirá brevemente algunos sistemas de cultivo de microalgas y de procesamiento, que pueden ser destinadas para diferentes mercados, entre los que se destaca la alimentación de humanos y animales, biofertilizantes, tratamiento de aguas, captura de CO2 y la generación de metabolitos de alto valor. Paralelamente, se ha avanzado en la generación de protocolos para el escalamiento de las microalgas mediante la formulación de medios orgánicos con residuos agroindustriales. También se ha desarrollado el cultivo en diferentes zonas del territorio costarricense, mostrando la posibilidad de adaptación en diferentes regiones climáticas.

Palabras Clave

Microalgas biorremediación biofertilizantes alimento animal

Microalgal biotechnology is presented as a market opportunity for the productive sector. In this review some aspects of the potential and limitations of this biotechnology sector for our region will be detailed. The visualization of this potential goes back more than a decade when the Biotechnology Research Center began the process of selecting and preserving native microalgae strains, and scaling-up their biomass. We will briefly describe some microalgae cultivation and microalgal biomass processing systems that can be used for different markets, including the feeding of humans and animals, biofertilizers, water treatment, CO2 capture and the generation of metabolites of high value. At the same time, progress has been made in the generation of protocols for the scaling of microalgae through the formulation of organic media with agroindustrial residues such as dairy manure, sugar cane, vinasse, pig manure and chicken manure. Cultivation has also been developed in different areas of the Costa Rican territory, showing the possibility for adaptation in different climatic regions.

Keywords

Microalgae bioremediation biofertilizer animal feed

Nombre de revista Persoonia

Año de publicación 2017

Número 4

Volumen 39

Página pagina

Autorización No

Proyecto 281

El orden Phyllachorales (Pezizomycotina, Ascomycota) es un grupo de hongos parásitos de plantas obligados biotróficos con una distribución tropical y alta especificidad de hospedador. Tradicionalmente se reconocen dos familias dentro de este orden: Phyllachoraceae y Phaeochoraceae, basadas principalmente en características morfológicas y del hospedador. Actualmente, la posición del orden dentro de la clase Sordariomycetes no es concluyente, así como la monofilia del orden y su estructura filogenética interna. Aquí presentamos una filogenia del orden Phyllachorales basada en datos de secuencia de 29 especies con una amplia gama de hospedadores resultante de un amplio muestreo geográfico. Inferimos la máxima probabilidad y las filogenias bayesianas a partir de los datos de cinco regiones de ADN: ADNr nrLSU, ADNr nrSSU, ADNr ITS y los genes codificadores de proteínas RPB2 y TEF1. Encontramos que el orden Phyllachorales es monofilético y relacionado a miembros de la subclase Sordariomycetidae dentro de Sordariomycetes. Dentro del orden, los miembros de la familia Phaeochoraceae forman un grupo monofilético, y la familia Phyllachoraceae se divide en dos linajes. Las reconstrucciones de estados ancestrales de máxima probabilidad indican que el antepasado de Phyllachorales tenía un monocotiledóneo planta huésped, peritecios sumergidos y estroma negro. Los estados alternativos de estos personajes evolucionaron varias veces de forma independiente dentro del orden. Con base en nuestros resultados redefinimos la familia Phyllachoraceae y proponemos la nueva familia Telimenaceae con Telimena erythrinae como especie tipo, lo que resulta en tres familias en el orden. Especies de Telimena spp. ocurren en varias plantas hospedantes monocotiledóneas y eudicotiledóneas excepto Poaceae, y generalmente tienen un pseudoestroma negro agrandado alrededor de la peritecia, un carácter que no está presente en especies de Phyllachoraceae.

Palabras Clave

reconstrucción del estado ancestral planta parasitaria hongos de la mancha de alquitrán Telimenaceae

The order Phyllachorales (Pezizomycotina, Ascomycota) is a group of biotrophic, obligate plant parasitic fungi with a tropical distribution and high host specificity. Traditionally two families are recognised within this order: Phyllachoraceae and Phaeochoraceae, based mostly on morphological and host characteristics. Currently, the position of the order within the class Sordariomycetes is inconclusive, as well as the monophyly of the order, and its internal phylogenetic structure. Here we present a phylogeny of the order Phyllachorales based on sequence data of 29 species with a broad host range resulting from a wide geographical sampling. We inferred Maximum Likelihood and Bayesian phylogenies from data of five DNA regions: nrLSU rDNA, nrSSU rDNA, ITS rDNA, and the protein coding genes RPB2, and TEF1. We found that the order Phyllachorales is monophyletic and related to members of the subclass Sordariomycetidae within Sordariomycetes. Within the order, members of the family Phaeochoraceae form monophyletic group, and the family Phyllachoraceae is split into two lineages. Maximum Likelihood ancestral state reconstructions indicate that the ancestor of Phyllachorales had a monocotyledonous host plant, immersed perithecia, and a black stroma. Alternative states of these characters evolved multiple times independently within the order. Based on our results we redefine the family Phyllachoraceae and propose the new family Telimenaceae with Telimena erythrinae as type species, resulting in three families in the order. Species of Telimena spp. occur in several monocotyledonous and eudicotyledonous host plants except Poaceae, and generally have enlarged black pseudostroma around the perithecia, a character not present in species of Phyllachoraceae.

Keywords

ancestral state reconstruction plant parasitic tar spot fungi Telimenaceae

Nombre de revista Mycol Progress

Año de publicación 2018

Número ND

Volumen 17

Página pagina

Autorización No

Proyecto 281

Coccodiella es un género de especies de plantas parasitarias en la familia Phyllachoraceae (Phyllachorales, Ascomycota), es decir, hongos tropicales de manchas de alquitrán. Miembros del género Coccodiella son de distribución tropical y son específicos de hospedante, creciendo en especies de plantas pertenecientes a nueve familias de plantas hospedantes. La mayoría de las especies conocidas se encuentran en varios géneros y especies del Melastomataceae en América tropical. En este estudio, describimos la nueva especie C. calatheae de Panamá, que crece en Calathea crotalifera (Marantaceae). Obtuvimos SU, nrLSU, y nrSSU secuencia de datos de esta nueva especie y de otras especímenes recién recolectados de cinco especies de Coccodiella en miembros de Melastomataceae de Ecuador y Panamá. Los análisis filogenéticos nos permitieron confirmar la ubicación de Coccodiella dentro de Phyllachoraceae, así como la monofilia del género. La filogenia de especies representativas dentro la familia Phyllachoraceae, incluida Coccodiella spp., especies graminícolas de Phyllachora y taxones con erumpent al estroma superficial de varias familias anfitrionas, sugiere que el género Phyllachora podría ser polifilético. Además, alquitrán Los hongos manchados con peritecios superficiales o erumpent parecen ser restringido a la familia Phyllachoraceae, independientemente de la planta huésped. También discutimos la biodiversidad y los patrones de plantas hospedantes de las especies de Coccodiella en todo el mundo.

Palabras Clave

Coccodiella calatheae Phyllachoraceae Planta parásitos Hongos de manchas de alquitrán Phyllachora Marantaceae Zingiberales

Coccodiella is a genus of plant-parasitic species in the family Phyllachoraceae (Phyllachorales, Ascomycota), i.e., tropical tar spot fungi. Members of the genus Coccodiella are tropical in distribution and are host-specific, growing on plant species belonging to nine host plant families. Most of the known species occur on various genera and species of the Melastomataceae in tropical America. In this study, we describe the new species C. calatheae from Panama, growing on Calathea crotalifera (Marantaceae). We obtained ITS, nrLSU, and nrSSU sequence data from this new species and from other freshly collected specimens of five species of Coccodiella on members of Melastomataceae from Ecuador and Panama. Phylogenetic analyses allowed us to confirm the placement of Coccodiella within Phyllachoraceae, as well as the monophyly of the genus. The phylogeny of representative species within the family Phyllachoraceae, including Coccodiella spp., graminicolous species of Phyllachora and taxa with erumpent to superficial stroma from several host families, suggests that the genus Phyllachora might be polyphyletic. Furthermore, tar spot fungi with superficial or erumpent perithecia seem to be restricted to the family Phyllachoraceae, independently of the host plant. We also discuss the biodiversity and host-plant patterns of species of Coccodiella worldwide.

Keywords

Coccodiella calatheae Phyllachoraceae Plant parasites Tar spot fungi Phyllachora Marantaceae Zingiberales

Nombre de revista Mycologia

Año de publicación 2018

Número 5

Volumen 110

Página pagina

Autorización No

Proyecto 281

Las especies de hongos tropicales de la mancha de alquitrán (Phyllachorales, Ascomycota) son plantas biotróficas obligatorias hongos parásitos asociados con hojas vivas de una amplia gama de familias de plantas hospedantes, principalmente en regiones tropicales y subtropicales. En este estudio, se recolectaron muestras de hongos tropicales de manchas de alquitrán en bosques de Costa Rica y Panamá. Para identificar taxones, utilizamos morfología e información sobre plantas hospedantes y filogenia multigénica combinada de cuatro genes: la gran subunidad nuclear ADN ribosómico (28S rDNA), el ADN ribosómico nuclear de subunidad pequeña (18S rDNA), el región espaciadora transcrita interna del ADN ribosómico (nuc rDNA ITS1-5.8S-ITS2; ITS), y el factor de elongación de traslación 1-α (tef1). Aquí te proponemos una nueva especie del género Camarotella y ocho nuevas especies en Telimena con sus descripciones morfológicas, ilustraciones y datos de secuencia. Las especies recientemente descritas son Camarotella licaniae en Licania. arborea (Chrysobalanaceae) y en el género Telimena: T. billiae sobre Billia rosea (Sapindaceae), T. drymoniae sobre Drymonia multiflora (Gesneriaceae), T. hydrangeae sobre Hydrangea sp. (Hydrangeaceae), T. miravallensis en Symplocos panamensis (Symplocaceae), T. protii en Protium sp. (Burseraceae), T. rinoreae sobre Rinorea sp. (Violaceae), T.semialarii en Semialarium mexicanum (Celastraceae) y T. triseptata en Tapirira mexicana (Anacardiaceae). El nuevo nombre Se presenta Telimena nitens sobre Schlegelia brachyanta (Schlegeliaceae) y 10 especies de Phyllachora se transfiere a Telimena, dando lugar a las nuevas combinaciones T. canarii, T. galavisii, T.insueta, T. ruelliae, T. scutiformis, T. serjaniicola, T. spicatae, T. subrepens, T. symploci y T. symplocicola. Además, las revisiones de los hongos de la mancha de alquitrán en las familias anfitrionas Burseraceae, Sapindaceae, y Symplocaceae, y se proponen cuatro nuevos sinónimos.

Palabras Clave

Camarotella Telimena hongos tropicales de manchas de alquitrán 19 nuevos taxones

Species of tropical tar spot fungi (Phyllachorales, Ascomycota) are obligate biotrophic plant parasitic fungi associated with living leaves of a wide range of families of host plants, mainly in tropical and subtropical regions. In this study, samples of tropical tar spot fungi were collected in forests in Costa Rica and Panamá. To identify taxa, we used morphology and information on host plants and combined multigene phylogeny of four genes: the large subunit nuclear ribosomal DNA (28S rDNA), the small subunit nuclear ribosomal DNA (18S rDNA), the complete internal transcribed spacer region of ribosomal DNA (nuc rDNA ITS1-5.8S-ITS2; ITS), and the translation elongation factor 1-α (tef1). Here we propose one new species in the genus Camarotella and eight new species in Telimena with their morphological descriptions, illustrations, and sequence data. The newly described species are Camarotella licaniae on Licania arborea (Chrysobalanaceae) and in the genus Telimena: T. billiae on Billia rosea (Sapindaceae), T. drymoniae on Drymonia multiflora (Gesneriaceae), T. hydrangeae on Hydrangea sp. (Hydrangeaceae), T. miravallensis on Symplocos panamensis (Symplocaceae), T. protii on Protium sp. (Burseraceae), T. rinoreae on Rinorea sp. (Violaceae), T. semialarii on Semialarium mexicanum (Celastraceae), and T. triseptata on Tapirira mexicana (Anacardiaceae). The new name Telimena nitens on Schlegelia brachyanta (Schlegeliaceae) is presented and 10 species of Phyllachora are transferred to Telimena, leading to the new combinations T. canarii, T. galavisii, T. insueta, T. ruelliae, T. scutiformis, T. serjaniicola, T. spicatae, T. subrepens, T. symploci, and T. symplocicola. Additionally, revisions of tar spot fungi on host families Burseraceae, Sapindaceae, and Symplocaceae are provided, and four new synonyms are proposed.

Keywords

Camarotella Telimena tropical tar spot fungi 19 new taxa

Nombre de revista Journal of Hazardous Materials

Año de publicación 2020

Número ND

Volumen 391

Página pagina

Autorización No

Proyecto 421

El uso creciente de nanopartículas de plata (AgNP) debido a su conocida actividad antimicrobiana, ha llevado a su acumulación en los ecosistemas del suelo. Sin embargo, el impacto de las concentraciones ambientales realistas de AgNP en el suelo. La comunidad microbiana ha sido escasamente estudiada. En este trabajo, hemos evaluado el impacto de los AgNP, que imitan los concentraciones en la naturaleza, en suelos tropicales cultivados con Coffea arabica bajo manejo convencional y orgánico sistemas. Evaluamos la biomasa, las actividades de las enzimas extracelulares y la diversidad de la comunidad microbiana del suelo, en un experimento del microcosmos en función del tiempo. Después de siete días de incubación, encontramos un aumento en la biomasa microbiana de una manera independiente de la concentración de AgNPs. Por el contrario, después de 60 días de incubación, hubo una disminución en Gram + y biomasa actinobacteriana, tanto en suelos como en todas las concentraciones de AgNPs. Las propiedades físico-químicas del suelo y las actividades enzimáticas no se vieron afectadas en general por los AgNP. En cuanto a la composición de la comunidad microbiana, solo algunos se observaron diferencias en la abundancia relativa a nivel de filo y género en la comunidad fúngica. Nuestros resultados sugieren que las concentraciones ambientales de AgNPs afectaron la biomasa microbiana pero tuvieron poco impacto sobre la microbiota diversidad y puede tener pocos efectos sobre los ciclos biogeoquímicos del suelo mediados por actividades de enzimas extracelulares.

Palabras Clave

Nanopartículas agrícolas Comunidad microbiana del suelo Actividades enzimáticas Biomasa

The increasing use of silver nanoparticles (AgNPs) due to their well-known antimicrobial activity, has led to their accumulation in soil ecosystems. However, the impact of environmental realistic concentrations of AgNPs on the soil microbial community has been scarcely studied. In this work, we have assessed the impact of AgNPs, that mimic real concentrations in nature, on tropical soils cultivated with Coffea arabica under conventional and organic management systems. We evaluated the biomass, extracellular enzyme activities, and diversity of the soil microbial community, in a microcosm experiment as a function of time. After seven days of incubation, we found an increase in microbial biomass in an AgNPs-concentration-independent manner. In contrast, after 60-day-incubation, there was a decrease in Gram + and actinobacterial biomass, in both soils and all AgNPs concentrations. Soil physico-chemical properties and enzyme activities were not affected overall by AgNPs. Regarding the microbial community composition, only some differences in the relative abundance at phylum and genus level in the fungal community were observed. Our results suggest that environmental concentrations of AgNPs affected microbial biomass but had little impact on microbial diversity and may have little effects on the soil biogeochemical cycles mediated by extracellular enzyme activities.

Keywords

Ag nanoparticles Soil microbial community Enzyme activities Biomass

Nombre de revista Animal Conservation

Año de publicación 2019

Número 5

Volumen 22

Página pagina

Autorización No

Proyecto 112

Disminución de anfibios mesoamericanos en hábitats aparentemente prístinos y protegidos han sido severos, especialmente en elevaciones por encima de los 500 m del nivel del mar y han sido vinculado a enfermedades emergentes y un clima cambiante. El Craugastor punctariolus La serie de especies de ranas en desarrollo directo es endémica de la región y solía ser compuesto por 33 especies, siete de las cuales tienen poblaciones conocidas en la actualidad. Uno de estos, C. ranoides, endémica del sur de Nicaragua y Costa Rica, se ha encontrado históricamente en sitios de bosque nuboso del Área de Conservaci en Guanacaste (ACG) en al noroeste de Costa Rica y se extendió a sitios de bosque seco a 20 km de distancia. Aquí, C. ranoides disminuyó y desapareció de los sitios de gran altitud entre los mediados de la década de 1980 y principios de la de 1990, pero las poblaciones persistieron en el bosque seco de las tierras bajas. Comparamos la riqueza genética y el estado de infección por ranavirus de C. ranoides desde las poblaciones existentes del bosque seco hasta los especímenes históricos de museos ahora extintos Poblaciones de bosques nubosos de ACG que utilizan diversidad de secuencias de ADN en dos loci y cribado molecular de ranavirus. Las poblaciones existentes de C. ranoides en el bosque seco formaron un grupo monofilético que incluía especímenes históricos muestreados en sitios de bosque nuboso. Sin embargo, la población extirpada del bosque nuboso ACG contenía diversidad adicional: las muestras formaron un clado divergente con distribución espacial desconocida. Se detectó ranavirus en muestras de C. ranoides y secuencias de una región de 267 nucleótidos de la proteína de la cápside principal gen compartió 100% de identidad de secuencia entre sí y con el virus Frog 3. Nuestro Los hallazgos documentan la diversidad críptica dentro de una especie en peligro de extinción que no ha demostrado recuperación en los bosques nubosos y plantea preguntas sobre el ranavirus y su posible vínculo con la disminución de anfibios en este sistema. La presencia de lo mismo El clado C. ranoides en muestras históricas y actuales sugiere un potencial para translocación y repoblación efectivas de las poblaciones de bosques nubosos extirpados.

Palabras Clave

Disminución de los anfibios enfermedades de los anfibios ranavirosis Virus de la rana 3 Craugastor ranoides Costa Rica diversidad críptica rana virus

Mesoamerican amphibian declines in apparently pristine and protected habitats have been severe, especially at elevations above 500 m sea level and have been linked to emerging diseases and a changing climate. The Craugastor punctariolus species series of direct developing frogs is endemic to the region and used to be comprised of 33 species, seven of which have known populations at present. One of these, C. ranoides, endemic to southern Nicaragua and Costa Rica, was historically found in cloud forest sites of Area de Conservaci

on Guanacaste (ACG) in north-west Costa Rica and extended into dry forest sites 20 km distant. Here, C. ranoides declined and disappeared from high elevation sites between the mid-1980s and early 1990s, but populations persisted in the lowland dry forest. We compared the genetic richness and ranavirus infection status of C. ranoides from extant dry forest populations to historic museum specimens of now extinct ACG cloud forest populations using DNA sequence diversity at two mitochondrial loci and molecular screening for ranavirus. Extant dry forest populations of C. ranoides formed a monophyletic group which included historic specimens sampled at cloud forest sites. However, the extirpated ACG cloud forest population contained additional diversity: samples formed a divergent clade with unknown spatial distribution. Ranavirus was detected in both current and museum samples of C. ranoides and sequences from a 267-nucleotide region of the major capsid protein gene shared 100% sequence identity with one another and with Frog virus 3. Our findings document cryptic diversity within an endangered species that has demonstrated no recovery in cloud forests and raises questions about Ranavirus and its potential link to the amphibian declines in this system. The presence of the same C. ranoides clade within present day and historical samples suggests a potential for effective translocation and repopulation of extirpated cloud forest populations.

Keywords

Amphibian declines amphibian diseases ranavirosis Frog virus 3 Craugastor ranoides Costa Rica cryptic diversity rana virus

Nombre de revista Antimicrobial Agents and Chemotherapy

Año de publicación 2017

Número 4

Volumen 61

Página pagina

Autorización No

Proyecto 618

Las tasas de resistencia a los antimicrobianos (RAM) y los niveles registrados para Clostridium difficile están aumentando. Este estudio informa la naturaleza, los niveles, la diversidad y la genómica contexto de la resistencia a los antimicrobianos de aislados de C. difficile humanos de la NAPCR1 / Genotipo RT012 / ST54, que provocó un brote en 2009 y es endémico en Costa Rica. Para ello, determinamos la susceptibilidad de 38 aislamientos de NAPCR1 a 10 antibióticos de siete clases utilizando Etests o pruebas de macrodilución y se examinaron 31 Secuencias de genoma completo de NAPCR1 para identificar polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) y genes que podrían explicar los fenotipos de resistencia observados. Los aislamientos de NAPCR1 eran multirresistentes (MDR) y comúnmente exhibían niveles de resistencia muy altos. Por secuenciando sus genomas, demostramos que poseían SNP asociados a resistencia en gyrA y rpoB y portaban de ocho a nueve resistencias antimicrobianas adquiridas (AMR) genes. La mayoría de estos genes se localizaron en elementos genéticos móviles conocidos o nuevos compartidos por aislamientos recuperados en diferentes hospitales y en diferentes momentos puntos. El metronidazol y la vancomicina siguen siendo las opciones de tratamiento de primera línea para estos aislados. En general, el linaje NAPCR1 mostró una capacidad mejorada para adquirir Genes AMR a través de la transferencia lateral de genes. Sobre la base de este hallazgo, recomendamos una mayor vigilancia y la adopción de mejores medidas de control para limitar la diseminación de este linaje y la aparición de más cepas MDR de C. difficile.

Palabras Clave

Clostridium difficile NAPCR1 multirresistencia genómica comparativa

The antimicrobial resistance (AMR) rates and levels recorded for Clostridium difficile are on the rise. This study reports the nature, levels, diversity, and genomic context of the antimicrobial resistance of human C. difficile isolates of the NAPCR1/ RT012/ST54 genotype, which caused an outbreak in 2009 and is endemic in Costa Rican hospitals. To this end, we determined the susceptibilities of 38 NAPCR1 isolates to 10 antibiotics from seven classes using Etests or macrodilution tests and examined 31 NAPCR1 whole-genome sequences to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) and genes that could explain the resistance phenotypes observed. The NAPCR1 isolates were multidrug resistant (MDR) and commonly exhibited very high resistance levels. By sequencing their genomes, we showed that they possessed resistance-associated SNPs in gyrA and rpoB and carried eight to nine acquired antimicrobial resistance (AMR) genes. Most of these genes were located on known or novel mobile genetic elements shared by isolates recovered at different hospitals and at different time points. Metronidazole and vancomycin remain the first-line treatment options for these isolates. Overall, the NAPCR1 lineage showed an enhanced ability to acquire AMR genes through lateral gene transfer. On the basis of this finding, we recommend further vigilance and the adoption of improved control measures to limit the dissemination of this lineage and the emergence of more C. difficile MDR strains.

Keywords

Clostridium difficile NAPCR1 multidrug resistance comparative genomics

Nombre de revista Biodiversity Data Journal

Año de publicación 2017

Número ND

Volumen 5

Página pagina

Autorización No

Proyecto 621

Fondo Se producen numerosas asociaciones bien documentadas entre especies de moscas de escotilla (Diptera: Phoridae) y hormigas (Hymenoptera: Formicidae), pero los ejemplos de parasitismo de cría son raros y los mecanismos del parasitismo a menudo quedan sin fundamento. Nueva información Presentamos dos ejemplos documentados en video de parasitismo de crías de hormigas (larvas y pupas) por moscas de escombros. En imágenes de la Estação Biológica de Boracéia en Brasil, hembras adultas se puede ver a Ceratoconus setipennis Borgmeier atacando a los trabajadores de Linepithema humile (Mayr) grupo de especies mientras llevan cría y ovipositan directamente sobre la cría en el nido. En otro ejemplo notable, metraje del Centro Soltis, cerca de Peñas Blancas en Costa Rica, muestra hembras adultas de una especie no identificada del grupo Apocephalus grandipalpus Borgmeier montando Pheidole Westwood cría boca abajo y ovipositando mientras las crías son transportadas por los trabajadores. Análisis evolutivo relaciones (en preparación) entre las especies de Apocephalus Coquillett muestra que esta es una comportamiento recién derivado dentro del género, ya que el grupo A. grandipalpus surge dentro de un grupo de parasitoides de hormigas adultas. En contraste, las relaciones de Ceratoconus Borgmeier no han se ha estudiado, y los estilos de vida de las otras especies del género son en gran parte desconocidos.

Palabras Clave

tropical parasitoides selva tropical biodiversidad

Background Numerous well-documented associations occur among species of scuttle flies (Diptera: Phoridae) and ants (Hymenoptera: Formicidae), but examples of brood parasitism are rare and the mechanisms of parasitism often remain unsubstantiated. New information. We present two video-documented examples of ant brood (larvae and pupae) parasitism by scuttle flies. In footage from Estação Biológica de Boracéia in Brazil, adult females of Ceratoconus setipennis Borgmeier can be seen attacking workers of Linepithema humile (Mayr) species group while they are carrying brood, and ovipositing directly onto brood in the nest. In another remarkable example, footage from the Soltis Center, near Peñas Blancas in Costa Rica, shows adult females of an unidentified species of the Apocephalus grandipalpus Borgmeier group mounting Pheidole Westwood brood upside-down and ovipositing while the brood are being transported by workers. Analysis of evolutionary relationships (in preparation) among Apocephalus Coquillett species shows that this is a newly derived behavior within the genus, as the A. grandipalpus group arises within a group of adult ant parasitoids. In contrast, relationships of Ceratoconus Borgmeier have not been studied, and the lifestyles of the other species in the genus are largely unknown.

Keywords

tropical parasitoids rain forest biodiversity

Nombre de revista Systematic Entomology

Año de publicación 2019

Número 1

Volumen 45

Página pagina

Autorización No

Proyecto 621

Al postular hipótesis evolutivas para diversos grupos de taxones utilizando datos moleculares, existe una compensación entre muestrear un gran número de taxones con unos pocos genes secuenciados por Sanger o muestrear menos taxones con cientos o miles de genes secuenciados de próxima generación. El muestreo de taxones altos permite analizar hipótesis evolutivas que son sensibles al sesgo de muestreo (es decir, datación, biogeografía y análisis de diversificación), mientras que el muestreo de caracteres altos mejora la resolución de nodos críticos. En un grupo de parasitoides de hormigas (Hymenoptera: Eucharitidae: Oraseminae). Analizamos ambos tipos de conjuntos de datos de forma independiente (203 taxones con cinco loci de Sanger, 92 taxones con 348 loci de enriquecimiento híbrido anclados) y en combinación (229 taxones, 353 loci) para explorar la datación por divergencia, la biogeografía, las relaciones con el anfitrión y las tasas diferenciales de diversificación. Oraseminae se especializan como parasitoides de las etapas inmaduras de las hormigas en la subfamilia Myrmicinae (Hymenoptera: Formicidae), con hormigas del género Pheidole siendo su anfitrión ancestral más común y presunto. Una suposición general es que la distribución del parásito debe estar limitada por cualquier contracción o expansión del rango de su anfitrión. Estudios recientes apoyan un único patrón de dispersión del Nuevo Mundo al Viejo Mundo para Pheidole en c. 11-27 Ma. Usando múltiples métodos de inferencia filogenética (parsimonia, probabilidad máxima, análisis bayesianos y coalescentes fechados), proporcionamos una filogenia que muestra que Oraseminae se dispersó en la dirección opuesta, desde el Viejo Mundo al Nuevo Mundo, c. 24-33 Ma, lo que implica que existían en el Viejo Mundo antes sus presuntos anfitriones ancestrales. Su dispersión en el Nuevo Mundo parece haber promovió una mayor tasa de diversificación. Tanto el huésped como el parasitoide muestran un solo Dispersiones unidireccionales de acuerdo con la presencia del Puente Terrestre de Beringia durante el Oligoceno, una época en la que el clima cambiante del norte probablemente limitó la capacidad de dispersión de tales grupos adaptados al trópico.

Palabras Clave

ND

When postulating evolutionary hypotheses for diverse groups of taxa using molecular data, there is a tradeoff between sampling large numbers of taxa with a few Sanger-sequenced genes or sampling fewer taxa with hundreds to thousands of next-generation-sequenced genes. High taxon sampling enables the testing of evolutionary hypotheses that are sensitive to sampling bias (i.e. dating, biogeography and diversification analyses), whereas high character sampling improves resolution of critical nodes. In a group of ant parasitoids (Hymenoptera: Eucharitidae: Oraseminae), we analyse both of these types of datasets independently (203 taxa with five Sanger loci, 92 taxa with 348 anchored hybrid enrichment loci) and in combination (229 taxa, 353 loci) to explore divergence dating, biogeography, host relationships and differential rates of diversification. Oraseminae specialize as parasitoids of the immature stages of ants in the subfamily Myrmicinae (Hymenoptera: Formicidae), with ants in the genus Pheidole being their most common and presumed ancestral host. A general assumption is that the distribution of the parasite must be limited by any range contraction or expansion of its host. Recent studies support a single New World to Old World dispersal pattern for Pheidole at c. 11–27 Ma. Using multiple phylogenetic inference methods (parsimony, maximum likelihood, dated Bayesian and coalescent analyses), we provide a robust phylogeny showing that Oraseminae dispersed in the opposite direction, from Old World to New World, c. 24–33 Ma, which implies that they existed in the Old World before their presumed ancestral hosts. Their dispersal into the New World appears to have promoted an increased diversification rate. Both the host and parasitoid show single unidirectional dispersals in accordance with the presence of the Beringian Land Bridge during the Oligocene, a time when the changing northern climate probably limited the dispersal ability of such tropically adapted groups.

Keywords

ND

Nombre de revista bioRxiv

Año de publicación 2019

Número ND

Volumen ND

Página pagina

Autorización No

Proyecto 314

Los frugívoros han desarrollado adaptaciones sensoriales y de comportamiento que les permiten encontrar frutas maduras de manera efectiva, pero la importancia relativa de los diferentes sentidos en diferentes escenarios de búsqueda de alimento es poco conocida. Dentro de los ecosistemas neotropicales, los murciélagos frugívoros de cola corta (Carollia: Phyllostomidae) son abundantes frugívoros nocturnos, que dependen principalmente de plantas del género Piper como recurso alimenticio. Investigaciones anteriores han demostrado que Carollia emplea el olfato y la ecolocalización para localizar la fruta Piper, pero se desconoce cómo su uso sensorial y sus decisiones de alimentación se ven influenciadas por la compleja diversidad de señales químicas que producen las plantas fructíferas. Utilizando C. castanea silvestre y su alimento preferido, Piper scintillans, realizamos experimentos de comportamiento para probar dos hipótesis principales: (1) las decisiones de alimentación en C. castanea son impulsadas principalmente por el aroma de fruta madura y, en segundo lugar, por el aroma de la vegetación, y (2) castanea vuelve a ponderar sus entradas sensoriales para tener en cuenta las señales ambientales disponibles, de modo que los murciélagos dependen más de la ecolocalización en ausencia de las señales olfativas adecuadas. Nuestros resultados sugieren que C. castanea requiere información olfativa y se basa casi exclusivamente en el aroma de fruta madura para realizar intentos de búsqueda de alimento. El aroma a fruta madura es químicamente distinto del aroma de la vegetación en P. scintillans, con una mayor abundancia de β-cariofileno, germacreno D y β-elemeno, y algunos compuestos únicos. Aunque la variación en los parámetros de las llamadas de ecolocalización fue independiente de la presencia de señales de olor, los murciélagos emitieron llamadas de ecolocalización más largas y frecuentes en los ensayos en los que no había olor a fruta. En conjunto, estos resultados destacan las adaptaciones, la plasticidad y las limitaciones potenciales en el sistema sensorial de los murciélagos frugívoros neotropicales.

Palabras Clave

ND

Frugivores have evolved sensory and behavioral adaptations that allow them to find ripe fruit effectively, but the relative importance of different senses in varying foraging scenarios is poorly known. Within Neotropical ecosystems, short-tailed fruit bats (Carollia: Phyllostomidae) are abundant nocturnal frugivores, relying primarily on plants of the genus Piper as a food resource. Previous research has demonstrated Carollia employ olfaction and echolocation to locate Piper fruit, but it is unknown how their sensory use and foraging decisions are influenced by the complex diversity of chemical cues that fruiting plants produce. Using wild C. castanea and their preferred food, Piper scintillans, we conducted behavioral experiments to test two main hypotheses: (1) foraging decisions in C. castanea are primarily driven by ripe fruit scent and secondarily by vegetation scent, and (2) C. castanea re-weight their sensory inputs to account for available environmental cues, such that bats rely more heavily on echolocation in the absence of adequate scent cues. Our results suggest that C. castanea requires olfactory information and relies almost exclusively on ripe fruit scent to make foraging attempts. Ripe fruit scent is chemically distinct from vegetation scent in P. scintillans, with a greater abundance of β-caryophyllene, germacrene D and β-elemene, and a few unique compounds. Although variation in echolocation call parameters was independent of scent cue presence, bats emitted longer and more frequent echolocation calls in trials where no fruit scent was present. Altogether, these results highlight the adaptations, plasticity, and potential constraints in the sensory system of neotropical fruit bats.

Keywords

ND

Nombre de revista Acta ZooBot Austria

Año de publicación 2019

Número ND

Volumen 156

Página pagina

Autorización No

Proyecto 632

Detección de hongos endófitos de cinco Palicourea costarricenses y tres Psychotria especie (Rubiaceae) que crece en los alrededores de la Estación Selva Tropical La Gamba resultó en la identificación de cepas pertenecientes al género Xylaria, Arthrinium, Fusarium, Clonostachys y Colletotrichum. Perfiles metabólicos de aislados Se analizaron los hongos. Se identificaron varios derivados de citocalasina, ácido pilifórmico así como los agentes antifúngicos griseofulvina y su derivado 7-declorogriseofulvina. Además, se encontró que la griseofulvina y su forma 7-decloro estaban secuestradas en el gotitas de evisceración de cuatro cepas. Efectos inhibidores del crecimiento contra varios microbios. Los organismos de prueba destacan el potencial de los hongos aislados para producir poderosos agentes antibióticos.

Palabras Clave

Palicourea Psychotria hongos endófitos Xylaria cytochalasin D

Screening of fungal endophytes from five Costa Rican Palicourea and three Psychotria species (Rubiaceae) growing in the surroundings of the Tropical Rainforest Station La Gamba resulted in the identification of strains belonging to the genera Xylaria, Arthrinium, Fusarium, Clonostachys and Colletotrichum. Metabolic profiles of isolated fungi were analyzed. Several cytochalasin derivatives, piliformic acid as well as the antifungal agents griseofulvin and its derivative 7-dechlorogriseofulvin were identified. Additionally, griseofulvin and its 7-dechloro form were found to be sequestered in the guttation droplets of four strains. Growth inhibiting effects against various microbial test organisms highlight the potential of the isolated fungi to produce powerful antibiotic agents.

Keywords

Palicourea Psychotria fungal endophytes Xylaria cytochalasin D

Nombre de revista PLoS ONE

Año de publicación 2018

Número 2

Volumen 13

Página pagina

Autorización No

Proyecto 606

Los hongos ascomicetos en los nidos de hormigas que habitan plantas (= mirmecofitas) son muy a menudo cultivado por las hormigas en pequeñas parcelas y utilizado como fuente de alimento. De donde vienen estos hongos de no se conoce todavía. Son posibles dos escenarios de reclutamiento de hongos: (1) infección aleatoria a través de esporas o fragmentos de hifas del medio ambiente, o (2) transmisión desde colonias de madre a hija por la reina fundadora. Tampoco se sabe en qué etapa de el ciclo de vida de la colonia se inicia el cultivo de hongos, y si los hongos simbiontes sirven como alimento para la reina de las hormigas. Para aclarar estas preguntas, investigamos cuatro especies de hormigas Azteca que habitan tres especies diferentes de Cecropia (C. insignis, C. obtusifolia y C. peltata). Analizamos un fragmento de gen de ARNr de 52 parches de hongos producidos por reinas fundadoras y los comparó con los de las colonias aztecas establecidas (n = 54). Los bolsillos infrabuccal de reinas aladas fueron disecados para investigar si las reinas jóvenes son portadoras de hongos de su colonia madre. Además, se realizaron experimentos de etiquetado con 15N para verificar si el la reina se alimenta de los parches hasta que es alimentada por su primera cría obrera. Inferimos de los resultados de que los hongos cultivados en estructuras vegetales huecas se transfieren de la colonia parental de la joven reina. Primero, la diversidad de genotipos de hongos / OTU no fue significativamente diferente entre parches de reina fundadora y colonias establecidas, y segundo, hifas Se descubrieron partes en los bolsillos infrabuccales de las aladas hembras. Podríamos demostrar que el cultivo de hongos ya comienza antes de que las reinas pongan sus huevos, y que las reinas no se alimentan del material del parche de hongos sino que lo alimentan a las larvas. Nuestros hallazgos sugieren que el fungicultivo puede ser crucial para la fundación exitosa de colonias de hormigas arbóreas en los trópicos.

Palabras Clave

ND

Ascomycete fungi in the nests of ants inhabiting plants (= myrmecophytes) are very often cultivated by the ants in small patches and used as food source. Where these fungi come from is not known yet. Two scenarios of fungus recruitment are possible: (1) random infection through spores or hyphal fragments from the environment, or (2) transmission from mother to daughter colonies by the foundress queen. It is also not known at which stage of the colony life cycle fungiculture is initiated, and whether the- symbiont fungi serve as food for the ant queen. To clarify these questions, we investigated four Azteca ant species inhabiting three different Cecropia species (C. insignis, C. obtusifolia, and C. peltata). We analysed an rRNA gene fragment from 52 fungal patches produced by founding queens and compared them with those from established Azteca colonies (n = 54). The infrabuccal pockets of winged queens were dissected to investigate whether young queens carry fungi from their mother colony. Additionally, 15N labelling experiments were done to verify whether the queen feeds on the patches until she is nourished by her first worker offspring. We infer from the results that the fungi cultivated in hollow plant structures are transferred from the parental colony of the young queen. First, fungal genotypes/OTU diversity was not significantly different between foundress queen patches and established colonies, and second, hyphal parts were discovered in the infrabuccal pockets of female alates. We could show that fungiculture already starts before queens lay their eggs, and that the queens do not feed on fungal patch material but feed it to the larvae. Our findings suggest that fungiculture may be crucial for successful colony founding of arboreal ants in the tropics.

Keywords

ND

Nombre de revista Mycological Progress

Año de publicación 2019

Número ND

Volumen 18

Página pagina

Autorización No

Proyecto 606

Varias especies de hongos melanizados (Bblack levadura ^) en el orden Chaetothyriales viven en asociación simbiótica con hormigas que habitan en cavidades de plantas (domatia) o con hormigas que utilizan material similar al cartón para la construcción de nidos y túneles. Para Investigar la base genética y la evolución de este estilo de vida, se secuenciaron los genomas de un linaje de cuatro cepas caetotirias.y los genes anotados. Si bien muchos miembros de Chaetothyriales tienen un gran conjunto de enzimas que mejoran la tolerancia de condiciones ambientales extremas o tóxicas, como suelo contaminado con benceno, tolueno, etilbenceno y xileno (BTEX), los miembros del clado domatia symbiont experimentaron contracciones importantes de la familia de genes. Esto incluye enzimas involucradas en procesos de desintoxicación como citocromo P450, transportadores y alcohol deshidrogenasas. En general, los genomas de las especies asociadas a domatia son relativamente pequeños en comparación con otros Chaetothyriales, con un bajo número de genes que codifican proteínas y con un alto contenido de elementos repetitivos. Agrupaciones biosintéticas involucradas en la producción de metabolitos secundarios y con potencial Las actividades antimicrobianas están sobrerrepresentadas en los genomas de estos hongos. Especulamos que, a pesar de la reducción de varios familias de proteínas, los miembros del clado asociado a domatia podrían tolerar, y quizás incluso metabolizar, compuestos tóxicos producido a partir de las glándulas exocrinas de las hormigas como defensa contra los microbios. Además, en esta asociación simbiótica, la planta y las hormigas podrían beneficiarse de la producción de metabolitos secundarios por parte de las Chaetothyriales que participan en este tripartito asociación. Consideramos una nueva clasificación ecológica para Chaetothyriales basada en características genómicas: (i) especies derivadas con alta abundancia de paralogs que colonizan hábitats ricos en poliaromáticos y (ii) productores potenciales de metabolitos secundarios con actividades antimicrobianas, beneficiosas para las interacciones simbióticas, ocupando microhábitats específicos como la hormiga domatia.

Palabras Clave

Levadura negra Hongos melanizados Hongos Domatia Ecología de hormigas Chaetothyriales Filogenia Genómica

Several species of melanized (Bblack yeast-like^) fungi in the order Chaetothyriales live in symbiotic association with ants inhabiting plant cavities (domatia) or with ants that use carton-like material for the construction of nests and tunnels. To investigate the genetic basis and evolution of this lifestyle, genomes of a lineage of four chaetothyrialean strains were sequenced and the genes annotated. While many members of Chaetothyriales have a large ensemble of enzymes enhancing tolerance of extreme or toxic environmental conditions, such as soil polluted with benzene, toluene, ethylbenzene, and xylene (BTEX), members of the domatia symbiont clade experienced significant gene family contractions. This includes enzymes involved in detoxification processes such as cytochrome P450s, transporters, and alcohol dehydrogenases. Overall, the genomes of domatiaassociated species are relatively small compared to other Chaetothyriales, with low numbers of protein-coding genes and with a high content of repetitive elements. Biosynthetic clusters involved in the production of secondary metabolites and with potential antimicrobial activities are overrepresented in the genomes of these fungi. We speculate that, despite the reduction of several protein families, members of the domatia-associated clade might tolerate, and perhaps even metabolize, toxic compounds produced from exocrine glands of the ants as defense against microbes. In addition, in this symbiotic association, the plant and the ants could benefit from the production of secondary metabolites by the Chaetothyriales that participate in this tripartite association. We consider a new ecological classification for Chaetothyriales based on genomic features: (i) derived species with high abundance of paralogs colonizing habitats rich in polyaromatic and (ii) potential producers of secondary metabolites with antimicrobial activities, beneficial for symbiotic interactions, occupying specific micro-habitats such as ant domatia.

Keywords

Black yeast Melanized fungi Domatia fungi Ant ecology Chaetothyriales Phylogeny Genomics

Nombre de revista Frontiers in Microbiology

Año de publicación 2019

Número 2060

Volumen 10

Página pagina

Autorización No

Proyecto 478

Se presume que algunos anfibios neotropicales, incluidas algunas especies en Costa Rica, estar "extinto" después de la dramática disminución de la población a fines de la década de 1980, pero ha sido redescubierto en poblaciones aisladas. Tales poblaciones parecen haber desarrollado un resistencia / tolerancia a Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), un patógeno fúngico que causa una enfermedad mortal de la piel y se considera uno de los principales impulsores de anfibios declina. El microbioma de la piel es un componente importante del sistema inmunológico innato y está asociado con la resistencia al Bd. Sin embargo, la forma en que la diversidad bacteriana del microbioma de la piel confiere protección contra el Bd para sobrevivir la especie sigue sin estar clara. Estudiamos la variación en el microbioma cutáneo y la prevalencia de taxones bacterianos putativamente anti-Bd en cuatro especies que cohabitan en las tierras altas del Parque Nacional Juan Castro Blanco en Costa Rica utilizando secuenciación de amplicones de ARNr 16S. Lithobates vibicarius, Craugastor escoces e Isthmohyla rivularis han sido recientemente redescubierto, mientras que Isthmohyla pseudopuma ha sufrido fluctuaciones de población pero nunca ha desaparecido. Para investigar la etapa de la vida en la que el protector El microbioma de la piel tiene forma y cuando se producen cambios en la diversidad de bacterias supuestamente antiBd, estudiamos el microbioma de la piel de renacuajos, juveniles y adultos de L. vibicarius. Mostramos que la composición bacteriana de la piel de especies simpátricas y los huéspedes con distintos estados de infección por Bd difieren a nivel de fila, familia y género. Detectamos 94 variantes de secuencia de amplicones (ASV) con actividad anti-Bd putativa pertenecientes a distintos taxones bacterianos, por ejemplo, Pseudomonas spp., Acinetobacter johnsonii, y Stenotrophomonas maltophilia. L. vibicarius no infectado con Bd albergaba un 79% más supuestamente anti-Bd ASV que los individuos infectados con Bd. Aunque la composición del microbioma y la estructura diferían a lo largo de las etapas de la vida, la diversidad de bacterias anti-Bd putativas fue similar entre las etapas pre y posmetamórfica de L. vibicarius. A pesar de lo bajo tamaño de la muestra, nuestros resultados apoyan la idea de que el microbioma de la piel es dinámico y protege contra la presencia continua de Bd en especies en peligro de extinción que persisten después de su presunta extinción. Nuestro estudio sirve como base para comprender los microbios patrones en especies de alto valor de conservación. Identificación de firmas microbianas vinculado a la variación en la susceptibilidad a las enfermedades podría, por lo tanto, informar las estrategias de mitigación para combatir el declive global de los anfibios

Palabras Clave

diversidad bacteriana de la piel secuenciación de amplicones de ARNr 16S Lithobates vibicarius escoltas de Craugastor Isthmohyla rivularis Isthmohyla pseudopuma Batrachochytrium dendrobatidis implicaciones para la salud

Some neotropical amphibians, including a few species in Costa Rica, were presumed to be “extinct” after dramatic population declines in the late 1980s but have been rediscovered in isolated populations. Such populations seem to have evolved a resistance/tolerance to Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), a fungal pathogen that causes a deadly skin disease and is considered one of the main drivers of worldwide amphibian declines. The skin microbiome is an important component of the host’s innate immune system and is associated with Bd-resistance. However, the way that the bacterial diversity of the skin microbiome confers protection against Bd in surviving species remains unclear. We studied variation in the skin microbiome and the prevalence of putatively anti-Bd bacterial taxa in four co-habiting species in the highlands of the Juan Castro Blanco National Park in Costa Rica using 16S rRNA amplicon sequencing. Lithobates vibicarius, Craugastor escoces, and Isthmohyla rivularis have recently been rediscovered, whereas Isthmohyla pseudopuma has suffered population fluctuations but has never disappeared. To investigate the life stage at which the protective skin microbiome is shaped and when shifts occur in the diversity of putatively antiBd bacteria, we studied the skin microbiome of tadpoles, juveniles and adults of L. vibicarius. We show that the skin bacterial composition of sympatric species and hosts with distinct Bd-infection statuses differs at the phyla, family, and genus level. We detected 94 amplicon sequence variants (ASVs) with putative anti-Bd activity pertaining to distinct bacterial taxa, e.g., Pseudomonas spp., Acinetobacter johnsonii, and Stenotrophomonas maltophilia. Bd-uninfected L. vibicarius harbored 79% more putatively anti-Bd ASVs than Bd-infected individuals. Although microbiome composition and structure differed across life stages, the diversity of putative anti-Bd bacteria was similar between pre- and post-metamorphic stages of L. vibicarius. Despite low sample size, our results support the idea that the skin microbiome is dynamic and protects against ongoing Bd presence in endangered species persisting after their presumed extinction. Our study serves as a baseline to understand the microbial patterns in species of high conservation value. Identification of microbial signatures linked to variation in disease susceptibility might, therefore, inform mitigation strategies for combating the global decline of amphibians.

Keywords

skin bacterial diversity 16S rRNA amplicon sequencing Lithobates vibicarius Craugastor escoces Isthmohyla rivularis Isthmohyla pseudopuma Batrachochytrium dendrobatidis health implications

Nombre de revista Uniciencia

Año de publicación 2020

Número 2

Volumen 34

Página pagina

Autorización No

Proyecto 591

El objetivo de este trabajo es determinar los parámetros sanguíneos y la presencia de parásitos en una población salvaje de tortugas deslizantes (Trachemys scripta emolli), durante la estación seca de 2013, en el Refugio de Vida Silvestre Caño Negro, Costa Rica. Utilizando redes, los individuos fueron capturados de diferentes huecos. Se tomó muestras de sangre para determinar los parámetros químicos de esta y el hematocrito, así como los valores morfológicos y las condiciones corporales. Además, se recolectaron muestras de heces y ectoparásitos. El IC del hematocrito 95.0 % fue [14 7091, 18 7356] y no se encontraron diferencias significativas entre los sexos. Los IC del 95 % para los parámetros de la química sanguínea fueron: AST (U/L) [87 6214, 148 929], CK (U/L) [1439.2, 2487.08], AU (umol/L) [68.22, 90.43], GLU (mmol/L) [4.26, 5.47], PHOS [0.46, 0.61], Ca (mmol/L) [1.99, 2.15], PT (g/L) [22.16, 24.44], K (mmol/L) [3.31, 3.83 ] y Na (mmol/L) [127.92, 130.93]. También se obtuvo 21 muestras de heces, de las cuales 10 fueron positivas para parásitos (23.8 % Strongyloides, 14.3 % Ascaridia, 9.5 % Coccidia y 9.5 % Pentastomida). Una sanguijuela de la familia Rhynchobdellidae fue el único ectoparásito encontrado (Placobdella sp.). Ninguno de los individuos estaba enfermo o presentaba abscesos en relación con sus atributos morfológicos. Según los resultados, el manejo empleado no representa un riesgo para esta población de reptiles.

Palabras Clave

parasitología microbiología ambiente salud laguna

The objective of this study was to determinate blood parameters and the presence of parasites in a wild population of tortugas deslizantes (Trachemys scripta emolli) during the dry season of 2013 in the Caño Negro Wildlife Refuge in Costa Rica. Individuals were captured from different gaps using nets. Blood samples were taken to determine chemical parameters of blood and hematocrit, as well as morphological values and body conditions. In addition, samples of feces and ectoparasites were collected. The hematocrit CI 95.0% was [14.7091, 18.7356] and no significant difference were found between sexes. The 95% CI for blood chemistry parameters were: AST (U/L) [87.6214, 148.929], CK (U/L) [1439.2, 2487.08], AU (umol/L) [68.22, 90.43 ], GLU (mmol/L) [4.26, 5.47], PHOS [0.46, 0.61], Ca (mmol/L) [1.99, 2.15], PT (g/L) [22.16, 24.44], K (mmol/L ) [3.31, 3.83], and Na (mmol/L) [127.92, 130.93]. A total of 21 fecal samples was obtained, of which 10 were positive for parasites (23.8% Strongyloides, 14.3% Ascaridia, 9.5% Coccidia, and 9.5% Pentastomid). A leech from the Rhynchobdellidae family was the only ectoparasite found (Placobdella sp.). None of the individuals were ill or had abscesses in relation to their morphological attributes. Based on the results, the handling used does not represent a risk for this reptile population.

Keywords

parasitology microbiology environment health status lagoon

Nombre de revista PLoS ONE

Año de publicación 2015

Número 2

Volumen 10

Página pagina

Autorización No

Proyecto 592

Varios estudios han sugerido que los microbios causan una mortalidad embrionaria significativa, mientras que la descomposición de los huevos rotos por las tortugas que anidan más tarde genera altas cargas microbianas. Esto ocurre comúnmente cuando la densidad de anidación es alta, especialmente durante eventos de anidación masiva ( arribadas). Sin embargo, ninguna investigación previa ha cuantificado directamente la abundancia microbiana y los efectos asociados sobre el éxito de la eclosión de tortugas marinas en una playa de anidación. El objetivo de este estudio fue probar la hipótesis de que la abundancia microbiana en la arena de los nidos de tortuga golfina afecta el éxito de la eclosión en Ostional, Costa Rica. Aplicamos tratamientos experimentales para alterar la abundancia microbiana dentro de la arena en la que se reubicaron los nidos. Monitoreamos la temperatura, el oxígeno y el contenido de materia orgánica durante todo el período de incubación y cuantificamos la abundancia microbiana dentro de la arena del nido mediante un análisis molecular de reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (qPCR). El tratamiento más exitoso para aumentar el éxito de la eclosión fue la remoción y reemplazo de la arena del nido.-1 arena de nido). De importancia secundaria para determinar el éxito de la eclosión fue la abundancia de bacterias (copias del gen del ARNr 16S bacteriano g -1 g-1 de arena del nido). Nuestros datos son consistentes con la hipótesis de que la alta actividad microbiana es responsable del menor éxito de eclosión observado en la playa de Ostional. Además, el mecanismo subyacente parece ser la privación de oxígeno y la exposición a temperaturas más altas como resultado de la descomposición microbiana en el nido.

Palabras Clave

ND

Several studies have suggested that significant embryo mortality is caused by microbes, while high microbial loads are generated by the decomposition of eggs broken by later nesting turtles. This occurs commonly when nesting density is high, especially during mass nesting events (arribadas). However, no previous research has directly quantified microbial abundance and the associated effects on sea turtle hatching success at a nesting beach. The aim of this study was to test the hypothesis that the microbial abundance in olive ridley sea turtle nest sand affects the hatching success at Ostional, Costa Rica. We applied experimental treatments to alter the microbial abundance within the sand into which nests were relocated. We monitored temperature, oxygen, and organic matter content throughout the incubation period and quantified the microbial abundance within the nest sand using a quantitative polymerase chain reaction (qPCR) molecular analysis. The most successful treatment in increasing hatching success was the removal and replacement of nest sand. We found a negative correlation between hatching success and fungal abundance (fungal 18S rRNA gene copies g-1 nest sand). Of secondary importance in determining hatching success was the abundance of bacteria (bacterial 16S rRNA gene copies g-1 g-1 nest sand). Our data are consistent with the hypothesis that high microbial activity is responsible for the lower hatching success observed at Ostional beach. Furthermore, the underlying mechanism appears to be the deprivation of oxygen and exposure to higher temperatures resulting from microbial decomposition in the nest.

Keywords

ND

Nombre de revista Biochimie

Año de publicación 2019

Número ND

Volumen 156

Página pagina

Autorización No

Proyecto 287

Las actinoporinas constituyen una clase única de toxinas formadoras de poros que se encuentran en las anémonas de mar y que, al ser secretadas como monómeros solubles, pueden unirse y permeabilizar las membranas que conducen a la muerte celular. El interés en estas proteínas ha aumentado debido a su alta citotoxicidad que puede usarse adecuadamente para diseñar inmunotoxinas contra células tumorales y sistemas de liberación de antígenos para el citosol celular. En este trabajo describimos una nueva actinoporina producida por Anthopleura nigrescens, una anémona que se encuentra en el Océano Pacífico centroamericano. Aquí presentamos la secuencia de aminoácidos de una actinoporina deducida del ADNc obtenido del ARN corporal total. La secuencia de ADN sintético que codifica una citolisinaLa variante se expresó en BL21 Star (DE3) Escherichia coli y la proteína se purificó mediante cromatografía en CM Sephadex C-25 con más del 97% de homogeneidad, como se verificó mediante análisis de MS-MS y HPLC. Esta actinoporina comprende 179 residuos de aminoácidos, de acuerdo con su masa molecular promedio de isótopos observada de 19 661 Da. La toxina carece de Cys y permeabiliza fácilmente los eritrocitos, así como las células L1210 . La espectroscopia de CD reveló que su estructura secundaria está dominada por la estructura beta (58,5%) con un 5,5% de α-hélicey 35% de estructura aleatoria. Además, los experimentos de unión a monocapas lipídicas y a los liposomas, así como los estudios de permeabilización en vesículas, revelaron que la afinidad de esta toxina por las membranas que contienen esfingomielina es bastante similar a la de la esticholisina II (StII). La comparación mediante técnicas espectroscópicas y el modelado de la estructura tridimensional de nigrelysin (Ng) mostró una alta homología con StII, pero también fueron detectables varias diferencias. Tomados en conjunto, estos resultados refuerzan la noción de que Ng es un miembro nuevo de la familia de toxinas formadoras de poros de actinoporina (PFT) con un HA tan alto como el de StII, la actinoporina más potente descrita hasta ahora, pero con características estructurales peculiares que contribuyen a ampliar la comprensión de la relación estructura-función en esta familia de proteínas

Palabras Clave

Anthopleura nigrescens Nigrelysin Toxina formadora de poros Actinoporina Actividad lítica Hemólisis

Actinoporins constitute a unique class of pore-forming toxins found in sea anemones that being secreted as soluble monomers are able to bind and permeabilize membranes leading to cell death. The interest in these proteins has risen due to their high cytotoxicity that can be properly used to design immunotoxins against tumor cells and antigen-releasing systems to cell cytosol. In this work we describe a novel actinoporin produced by Anthopleura nigrescens, an anemone found in the Central American Pacific Ocean. Here we report the amino acid sequence of an actinoporin as deduced from cDNA obtained from total body RNA. The synthetic DNA sequence encoding for one cytolysin variant was expressed in BL21 Star (DE3) Escherichia coli and the protein purified by chromatography on CM Sephadex C-25 with more than 97% homogeneity as verified by MS-MS and HPLC analyses. This actinoporin comprises 179 amino acid residues, consistent with its observed isotope-averaged molecular mass of 19 661 Da. The toxin lacks Cys and readily permeabilizes erythrocytes, as well as L1210 cells. CD spectroscopy revealed that its secondary structure is dominated by beta structure (58.5%) with 5.5% of α-helix, and 35% of random structure. Moreover, binding experiments to lipidic monolayers and to liposomes, as well as permeabilization studies in vesicles, revealed that the affinity of this toxin for sphingomyelin-containing membranes is quite similar to sticholysin II (StII). Comparison by spectroscopic techniques and modeling the three-dimensional structure of nigrelysin (Ng) showed a high homology with StII but several differences were also detectable. Taken together, these results reinforce the notion that Ng is a novel member of the actinoporin pore-forming toxin (PFT) family with a HA as high as that of StII, the most potent actinoporin so far described, but with peculiar structural characteristics contributing to expand the understanding of the structure-function relationship in this protein family

Keywords

Anthopleura nigrescens Nigrelysin Pore-forming toxin Actinoporin Lytic activity Hemolysis

Nombre de revista Molecular Ecology

Año de publicación 2012

Número 14

Volumen 21

Página pagina

Autorización No

Proyecto 275

El árbol con hormigas Neotropical Cordia alliodora anfitriones simbióticas Azteca hormigas en la mayor parte de su área de distribución generalizada. La taxonomía del género Azteca es notoriamente difícil, lo que con frecuencia ha oscurecido la identidad de las especies en los estudios ecológicos. Usamos datos de secuencia de un loci mitocondrial y cuatro nucleares para inferir relaciones filogenéticas, patrones de distribución geográfica y tiempo de diversificación para 182 colonias de cinco especies de Azteca que habitan en C. alliodora desde México hasta Colombia. Todas las especies morfológicas fueron recuperadas como monofiléticas, pero identificamos al menos cinco linajes genéticos distintos dentro de la especie más abundante y especializada, Azteca pittieri.. Los datos mitocondriales y nucleares fueron concordantes a nivel de especie, pero no dentro de especie. Los análisis de tiempo de divergencia estimaron que C. alliodora, habitante de Azteca, compartía un ancestro común hace aproximadamente 10 a 22 millones de años, antes de la llegada propuesta del árbol huésped a América Central. La diversificación en A. pittieri ocurrió en el Pleistoceno y no se correlacionó con la distancia geográfica, lo que sugiere un flujo genético histórico limitado entre poblaciones geográficamente restringidas. Esto contrasta con la falta de estructura filogeográfica informada anteriormente a esta escala espacial en el árbol huésped. Los nichos climáticos, y particularmente las variables relacionadas con la precipitación, no se superpusieron entre los sitios ocupados por los linajes norte y sur deA. pittieri . Juntos, estos resultados sugieren que el flujo genético restringido entre las poblaciones de hormigas puede facilitar la adaptación local a la heterogeneidad ambiental. Las diferencias en la estructura de la población entre las hormigas y sus árboles hospedantes pueden afectar profundamente la dinámica evolutiva de este mutualismo entre hormigas y plantas

Palabras Clave

mutualismo hormiga-planta Árboles genéticos de Cordia alliodora Filogeografía de América Central El clima del Pleistoceno cambia estacionalmente los bosques tropicales secos

The Neotropical myrmecophytic tree Cordia alliodora hosts symbiotic Azteca ants in most of its widespread range. The taxonomy of the genus Azteca is notoriously difficult, which has frequently obscured species identity in ecological studies. We used sequence data from one mitochondrial and four nuclear loci to infer phylogenetic relationships, patterns of geographic distribution, and timing of diversification for 182 colonies of five C. alliodora-dwelling Azteca species from Mexico to Colombia. All morphological species were recovered as monophyletic, but we identified at least five distinct genetic lineages within the most abundant and specialized species, Azteca pittieri. Mitochondrial and nuclear data were concordant at the species level, but not within species. Divergence time analyses estimated that C. alliodora-dwelling Azteca shared a common ancestor approximately 10–22 million years ago, prior to the proposed arrival of the host tree in Middle America. Diversification in A. pittieri occurred in the Pleistocene and was not correlated with geographic distance, which suggests limited historical gene flow among geographically restricted populations. This contrasts with the previously reported lack of phylogeographic structure at this spatial scale in the host tree. Climatic niches, and particularly precipitation-related variables, did not overlap between the sites occupied by northern and southern lineages of A. pittieri. Together, these results suggest that restricted gene flow among ant populations may facilitate local adaptation to environmental heterogeneity. Differences in population structure between the ants and their host trees may profoundly affect the evolutionary dynamics of this widespread ant–plant mutualism

Keywords

ant–plant mutualism Cordia alliodora gene trees Middle America phylogeography Pleistocene climate changes seasonally dry tropical forests

Nombre de revista Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

Año de publicación 2012

Número 18

Volumen 22

Página pagina

Autorización No

Proyecto 188

Dirigir e inhibir CMG2 (proteína 2 del gen de morfogénesis capilar) representa una nueva estrategia para agentes terapéuticos para el cáncer y las enfermedades de la retina debido al papel de CMG2 en el crecimiento de los vasos sanguíneos (angiogénesis). Se desarrolló un ensayo FRET (transferencia de energía por resonancia de Förster) de alto rendimiento para la identificación de inhibidores de CMG2 como agentes anti-angiogenéticos. La separación guiada por bioensayo condujo al aislamiento e identificación de dos nuevos compuestos ( 1 y 2 ) de CR252M, un hongo endofítico Coccomyces proteae recolectado de una selva tropical de Costa Rica y un compuesto conocido ( 3 ) de CR1207B (Aurapex penicillata) . Los ensayos secundarios in vitro indicaron actividad antiangiogénica. Compuesto 3inhibió la migración de células endoteliales a 52 µM, pero no mostró ningún efecto antiproliferativo de células endoteliales a 156 µM. La estructura de los dos nuevos compuestos, A ( 1 ) y B ( 2 ), se dilucidó sobre la base de un extenso análisis espectroscópico, incluidos experimentos de RMN 1D y 2D

Palabras Clave

Hongo Coccomyces proteae Aurapex penicillata CMG2 Fenólico

Targeting and inhibiting CMG2 (Capillary Morphogenesis Gene protein 2) represents a new strategy for therapeutic agents for cancer and retinal diseases due to CMG2’s role in blood vessel growth (angiogenesis). A high throughput FRET (Förster Resonance Energy Transfer) assay was developed for the identification of CMG2 inhibitors as anti-angiogenetic agents. Bioassay-guided separation led to the isolation and identification of two new compounds (1 and 2) from CR252M, an endophytic fungus Coccomyces proteae collected from a Costa Rican rainforest, and one known compound (3) from CR1207B (Aurapex penicillata). Secondary in vitro assays indicated anti-angiogenic activity. Compound 3 inhibited the endothelial cell migration at 52 μM, but did not show any endothelial cell antiproliferative effect at 156 μM. The structure of the two new compounds, A (1) and B (2), were elucidated on the basis of extensive spectroscopic analysis, including 1D and 2D NMR experiments

Keywords

Fungus Coccomyces proteae Aurapex penicillata CMG2 Phenolic

Nombre de revista Brittonia

Año de publicación 2016

Número ND

Volumen 68

Página pagina

Autorización No

Proyecto 669

Hicimos un análisis filogenético en 21 de las 23 especies de Stigmatopteris , un género montano neotropical de suelos de bosques húmedos. El análisis se basó en cuatro marcadores de plastidios: rbcL, rps4-trnS, trnG-trnR y trnL-trnF . Dos de las familias más estrechamente relacionadas con Dryopteridaceae (Didymochlaenaceae e Hypodematiaceae) y 12 géneros de dryopteroides se utilizaron como grupos externos. Se mapearon ocho caracteres morfológicos en el árbol resultante. Stigmatopteris se recuperó como monofilético y hermano de un clado formado por helechos polistichoides como Arachniodes, Dryopteris y Polystichum . Sinapomorfias que distinguen a Stigmatopterisson láminas 1-pinnadas-pinnatífidas, glándulas puntiformes visibles en el mesófilo, presencia de hidatodos, cilios uniseriados en los márgenes de las escamas y pérdida de indusia. Dentro del género hay dos clados principales. La primera está formada por cuatro especies caracterizadas por pinnas largo decurrente en al menos el tercio distal de la lámina. El segundo consta de las 17 especies restantes en el análisis y no tiene sinapomorfias morfológicas conocidas. Anidado dentro de este segundo clado hay un subclade de seis especies endémicas del sureste de Brasil. Las venas anastomosantes, un carácter que se utiliza a menudo en las claves para distinguir las especies, evolucionaron tres veces dentro del género

Palabras Clave

secoopteroide eupólípodo leptosporangios pteridofito sistemática

We did a phylogenetic analysis on 21 of the 23 species of Stigmatopteris, a neotropical montane genus of wet forest floors. The analysis was based on four plastid markers: rbcL, rps4-trnS, trnG-trnR, and trnL-trnF. Two of the most closely related families to the Dryopteridaceae (Didymochlaenaceae and Hypodematiaceae) and 12 dryopteroid genera were used as outgroups. Eight morphological characters were mapped on the resulting tree. Stigmatopteris was recovered as monophyletic and sister to a clade formed by polystichoid ferns such as Arachniodes, Dryopteris, and Polystichum. Synapomorphies that distinguish Stigmatopteris are 1-pinnate-pinnatifid laminae, visible punctate glands in the mesophyll, the presence of hydathodes, uniseriate cilia on the scale margins, and loss of indusia. Within the genus are two main clades. The first consists of four species characterized by pinnae long-decurrent in at least the distal third of the lamina. The second consists of the remaining 17 species in the analysis and has no known morphological synapomorphies. Nested within this second clade is a subclade of six species endemic to southeastern Brazil. Anastomosing veins, a character often used in keys to distinguish the species, evolved three times within the genus

Keywords

dryopteroid eupolypod leptosporangiates pteridophyte systematics

Nombre de revista Arachnology

Año de publicación 2021

Número 8

Volumen 18

Página pagina

Autorización No

Proyecto 360

Las arañas pueden modificar su comportamiento de construcción de telarañas de acuerdo con las condiciones ambientales. Aquí, examinamos cómo la estructura de la red de Tetragnatha tenuissima se diferencia según el tipo de hábitat (pantano o borde de río) en la Estación Biológica La Selva, Costa Rica. Caracterizamos la arquitectura web en función de la longitud, el número de radios y el espaciado de las espirales en relación con la longitud de la web. No hubo diferencias significativas en la longitud o el número de radios entre las redes presentes en los hábitats de los pantanos y ríos. En términos del espaciado de las espirales en relación con la longitud de la red, hubo una diferencia significativa entre los hábitats, con menos distancia en las redes a orillas del río que en los pantanos. Esto podría explicarse por la posible disponibilidad diferencial de recursos en cada entorno. Por lo tanto, el tipo de hábitat aparece como una variable explicativa de las diferencias en la estructura de la red de T. tenuissima. Debido al pequeño número de individuos identificables de otras especies de Tetragnatha, el efecto de la coexistencia de especies congenéricas en la estructura de la red sigue siendo un factor que debe probarse en investigaciones futuras.

Palabras Clave

Costa Rica adaptación del hábitat partición de nichos arañas que tejen orbitales diferenciación de la telaraña estructura de la telaraña

Spiders can modify their web construction behaviour according to environmental conditions. Here, we examined how the web structure of Tetragnatha tenuissima differentiates depending on habitat type (swamp or river edge) at La Selva Biological Station, Costa Rica. We characterized the web architecture based on length, number of radii, and the spiral spacing relative to web length. There were no significant differences on the length or number of radii between the webs present in the swamp and river habitats. In terms of the spiral spacing relative to web length, there was a significant difference between habitats, with less distance in river-side webs than in the ones on swamps. This could be explained by the potential differential resource availability on each environment. Therefore, habitat type appears as an explanatory variable for differences on the web structure of T. tenuissima. Due to the small number of identifiable individuals of other Tetragnatha species, the effect of congeneric species co-occurrence on web structure remains as a factor to be tested in future research.

Keywords

Costa Rica habitat adaptation niche partitioning orbweaving spiders web differentiation web structure

Nombre de revista Zoological Journal of the Linnean Society

Año de publicación 2021

Número XX

Volumen na

Página pagina

Autorización No

Proyecto 631

La diversidad vocal podría reflejar la organización social y sustentar la coexistencia de especies crípticas en simpatía. Para probar hasta qué punto el comportamiento vocal separa las especies simpátricas y crípticas de la radiación de un murciélago, comparamos las vocalizaciones de Carollia castanea, Carollia sowelli y Carollia perspicillata confirmadas genéticamente emitidas por díadas intraespecíficas de individuos identificados durante las correspondientes interacciones de interferencia física en la percha. El análisis de video reveló un comportamiento y un tiempo de interacción similares entre las especies. Una clasificación visual basada en sonagramas de sílabas de vocalización de contorno de tiempo-frecuencia ininterrumpida discriminó 21 clases de sílabas. El uso de clases y la distribución de las cuatro clases compartidas difieren entre especies. Carollia sowelli emitió el menor número de clases en total y por interacción entre especies y mostró un número limitado de composiciones de sílabas en los episodios. Los análisis discriminatorios de las sílabas de una clase común y compartida proporcionaron evidencia del carácter distintivo de las especies y las firmas específicas de cada individuo. En general, el sexo no tuvo en cuenta la variabilidad de los datos. Las vocalizaciones presentes combinan sílabas reportadas de contextos agresivos y sumisos en C. perspicillata y podrían expresar ambivalencia experimentada durante la interferencia en la percha. Se discute la diversidad del comportamiento vocal entre congéneres como resultado de diferentes presiones ecológicas durante la especiación alopátrica y como un indicador de diferencias en la organización social de las especies.

Palabras Clave

comunicación acústica Carollia castanea Carollia perspicillata - Carollia sowelli especies crípticas firmas de llamada specíficas de un individuo análisis de llamada multiparamétrico filogenia específico de la especie firmas de llamada.

Vocal diversity might reflect the social organization and sustain the coexistence of cryptic species in sympatry. To test the extent to which vocal behaviour separates sympatric, cryptic species of a bat radiation, we compared vocalizations of genetically confirmed Carollia castanea, Carollia sowelli and Carollia perspicillata emitted by intraspecific dyads of identified individuals during corresponding physical interference interactions at the perch. Video analysis revealed a similar behaviour and interaction time across species. A sonagram-based visual classification of vocalization syllables of uninterrupted frequency–time contour discriminated 21 syllable classes. Class usage and distribution of the four shared classes differed across species. Carollia sowelli emitted the lowest number of classes in total and per interaction across species and displayed a limited number of syllable compositions in bouts. Discriminant analyses of syllables of a common, shared class provided evidence for species distinctiveness and individual-specific signatures. In general, sex did not account for data variability. The present vocalizations combine syllables reported from aggressive and submissive contexts in C. perspicillata and might express experienced ambivalence during interference at the perch. The diversity of vocal behaviour across congeners is discussed as arising from different ecological pressures during allopatric speciation and as an indicator of differences in species social organization.

Keywords

acoustic communication Carollia castanea Carollia perspicillata Carollia sowelli cryptic species individual specific call signatures multiparametric call analysis hylogeny speciesspecific call signatures.

Nombre de revista The Newsletter of the Orthopterists´Society

Año de publicación 2016

Número 36

Volumen 6

Página pagina

Autorización No

Proyecto 651

nd

Palabras Clave

na

nd

Keywords

na

Nombre de revista Journal of Medical Entomology

Año de publicación 2021

Número 6

Volumen 58

Página pagina

Autorización No

Proyecto 613

Los patógenos transmitidos por mosquitos se han propagado a través de las regiones tropicales del Hemisferio Oeste, causando una mayor carga de enfermedades en la región. En los últimos años se han producido brotes de dengue, fiebre amarilla, chikungunya, West Nile y Zika. Los patrones de alimentación de sangre de mosquitos necesitan ser analizados para ayudar a determinar qué vertebrados podrían actuar como huéspedes de estos patógenos transmitidos por mosquitos y qué especies de mosquitos podrían actuar como vectores. Realizamos análisis de sangre de mosquitos recolectados en la Reserva Biológica Lomas Barbudal, una reserva de bosque tropical seco en Costa Rica. Los mosquitos fueron recolectados usando aspiradores de mochila y trampas de luz, gravid y en reposo, y luego identificados morfológicamente. Los mosquitos alimentados con sangre se sometieron a extracción de ADN, amplificación de PCR y secuenciación de los genes de citocromo b y citocromo c oxidasa 1 de los vertebrados para identificar a los huéspedes. Se encontraron varios mosquitos que se sabe que son vectores de patógenos, incluyendo Culex (Melanoconion) erraticus Dyar & Knab (Diptera: Culicidae), Cx. (Mel.) Pedroi Sirivanakarn & Belkin, Aedes (Stegomyia) albopictus Skuse, AE. (Ochlerotatus) scapularis Rondani, Ae. (Och.) serrato Theobald, y Ae. (Och.) taeniorhynchus Wiedemann. Los huéspedes más comunes fueron los lagartos basilisk (Basiliscus vittatus) Wiegmann (Squamata: Corytophanidae) en las especies Culex (Linnaeus) y el venado de cola blanca (Odocoileus virginia) Zimmermann (Artiodactyla: Cervidae) en especies de Aedes (Meigen). Estos resultados muestran la diversidad de especies de mosquitos en un bosque tropical seco e identifican las asociaciones entre los vectores de mosquitos y los potenciales hospedantes de reservorios patógenos. Nuestro estudio destaca la importancia de comprender las interacciones entre las especies de vectores y sus huéspedes que podrían servir como predictores de la posible emergencia o resurgimiento de patógenos transmitidos por mosquitos en Costa Rica.

Palabras Clave

ecología; comportamiento alimentación; biología molecular; enfermedades transmitidas por mosquitos; entomología tropical

Mosquito-borne pathogens have spread throughout tropical regions of the Western Hemisphere causing increased burden of disease in the region. Outbreaks of dengue fever, yellow fever, chikungunya, West Nile, and Zika have occurred over the past several years. Mosquito blood-feeding patterns need to be assayed to assist in determining which vertebrates could act as hosts of these mosquito-borne pathogens and which mosquito species could act as vectors. We conducted bloodmeal analyses of mosquitoes collected at Lomas Barbudal Biological Reserve, a dry tropical forest reserve in Costa Rica. Mosquitoes were collected using backpack aspirators and light, gravid, and resting traps, and then identified morphologically. Blood-fed mosquitoes underwent DNA extraction, PCR amplification, and sequencing of the vertebrate cytochrome b and cytochrome c oxidase 1 genes to identify vertebrate bloodmeal hosts. Several mosquitoes known to vector pathogens were found including Culex (Melanoconion) erraticus Dyar & Knab (Diptera: Culicidae), Cx. (Mel.) pedroi Sirivanakarn & Belkin, Aedes (Stegomyia) albopictus Skuse, Ae. (Ochlerotatus) scapularis Rondani, Ae. (Och.) serratus Theobald, and Ae. (Och.) taeniorhynchus Wiedemann. The most common bloodmeal hosts were basilisk lizards (Basiliscus vittatus) Wiegmann (Squamata: Corytophanidae) in Culex (Linnaeus) species and white-tailed deer (Odocoileus virginianus) Zimmermann (Artiodactyla: Cervidae) in Aedes (Meigen) species. These results show the diversity of mosquito species in a tropical dry deciduous forest and identify associations between mosquito vectors and potential pathogen reservoir hosts. Our study highlights the importance of understanding interactions between vector species and their hosts that could serve as predictors for the potential emergence or resurgence of mosquito-borne pathogens in Costa Rica.

Keywords

ecology; feeding-behavior; molecular biology; mosquito-borne disease; tropical entomology

Nombre de revista Molecules

Año de publicación 2022

Número Volume 27 Issue 13

Volumen 27

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Autorización No

Proyecto 852

El uso de sustancias o condiciones como elicitores puede aumentar significativamente la producción de metabolitos secundarios. En esta investigación, se evaluaron los efectos de diferentes elicitores en la producción de metabolitos secundarios antioxidantes en una cepa de Ganoderma sp. antioxidantes en una cepa de Ganoderma sp. Los elicitores ensayados fueron fueron cambios de pH en diferentes fases de crecimiento del hongo (pH 3, 5,5 y 8), diferentes concentraciones de peptona como fuente de nitrógeno (1 g/L y 10 g/L), y la adición de agentes químicos al medio de cultivo (etanol, reguladores de crecimiento y sales). El pH alcalino durante la fase estacionaria y la alta disponibilidad de nitrógeno fueron elicitores eficaces, produciendo cultivos con mayor actividad antioxidante antioxidante (37,87 g/L y 43,13 g/L de biomasa seca) aunque no hubo diferencias significativas con otros tratamientos.

Palabras Clave

pH; peptona; ORAC; reguladores de crecimiento; ethanol; sales

The use of substances or conditions as elicitors can significantly increase the production of secondary metabolites. In this research, the effects of different elicitors on the production of antioxidant secondary metabolites were evaluated in a strain of Ganoderma sp. The elicitors tested were pH changes in different growth phases of the fungus (pH 3, 5.5 and 8), different concentrations of peptone as a nitrogen source (1 g/L and 10 g/L), and the addition of chemical agents to the culture medium (ethanol, growth regulators, and salts). The alkaline pH during the stationary phase and the high availability of nitrogen were effective elicitors, producing cultures with higher antioxidant activity (37.87 g/L and 43.13 g/L dry biomass) although there were no significant differences with other treatments

Keywords

pH; peptone; ORAC; growth regulators; ethanol; salts

Nombre de revista Revista Colombiana de Investigaciones Agroindustriales

Año de publicación 2022

Número 9

Volumen 2

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Autorización No

Proyecto 1064

El fruto de la fresa (Fragaria x ananassa) es un alimento ampliamente consumido a nivel mundial, y al cual se le han atribuido una amplia gama de propiedades beneficiosas para la salud humana, mayoritariamente asociadas a su potencial antioxidante. La búsqueda de fitoquímicos bioactivos en la fresa se ha enfocado en el fruto, mientras que el perfil bioquímico de las hojas ha sido poco estudiado y sigue siendo poco aprovechado, a pesar de constituir una fuente potencial de metabolitos bioactivos que podrían ser utilizados en la formulación de productos para el sector alimenticio, industrial y farmacéutico. Además, se ha reportado mayor contenido de polifenoles bioactivos en las hojas de fresa que en el fruto, y las hojas de fresa podrían ser una fuente importante de ácido elágico, un compuesto antioxidante bioactivo poco abundante en la dieta humana pero de gran potencial biomédico. Este artículo de revisión bibliográfica tiene como objetivo evaluar las características del cultivo de fresa (Fragaria x ananassa) en Costa Rica, con miras al aprovechamiento integral de los residuos agroindustriales de este cultivo. La información consultada demostró que la comercialización del cultivo de fresa se enfoca en el fruto, mientras que las hojas y el resto del material vegetativo de la planta se descartan periódicamente, y podrían ser incorporados en nuevas cadenas productivas. Este tipo de estrategias son de especial importancia para países pequeños en desarrollo y con economías de base agrícola, para mejorar el aprovechamiento de los residuos agroindustriales y darles un mayor valor agregado a los cultivos, en beneficio del ambiente y la salud humana.

Palabras Clave

economía circular, fresa, hoja, polifenoles, agroindustria

Strawberry fruit (Fragaria x ananassa) is a widely consumed food worldwide and has been characterized to have a wide range of beneficial properties for human health, mostly associated with its antioxidant potential. The search for bioactive phytochemicals in strawberry has focused mainly on the fruit, while the biochemical profile of the leaves has been little studied and continues to be underutilized, despite being a potential source of bioactive metabolites that could be used in the formulation of food, industrial and pharmaceutical products. In addition, higher bioactive polyphenol content has been reported in strawberry leaves than in the fruit, and strawberry leaves could also be an important source of ellagic acid, a bioactive antioxidant compound, which is limited in the human diet but has great biomedical potential. This literature review aims to evaluate the information available on the characteristics of strawberry crops (Fragaria x ananassa) in Costa Rica, targeting towards the comprehensive use of the agro-industrial residues of this plant. The information reviewed confirmed that the commercialization of strawberry cultivation focuses on the fruit, while the leaves and the rest of the plant's vegetative material are discarded periodically, but could be incorporated into new production chains. Such strategies are especially important for small developing countries with agricultural-based economies, to improve the use of agro-industrial waste and provide added value to crops, aiding both the environment and human health.

Keywords

circular economy, strawberry, leaf, polyphenols, agroindustry

Nombre de revista Applied Microbiology

Año de publicación 2021

Número 1

Volumen 1

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Autorización No

Proyecto 387

El microbioma de la piel es una parte importante de las defensas inmunitarias de los anfibios y protege contra patógenos como el hongo quitridio Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), que causa la enfermedad cutánea quitridiomicosis. La alteración del microbioma por factores antropogénicos, como los pesticidas, puede afectar a este rasgo protector, alterando su funcionalidad. El clorotalonil es un fungicida ampliamente utilizado que se ha reconocido que tiene un impacto en los anfibios, pero hasta ahora, ningún estudio ha investigado sus efectos en las comunidades microbianas de los anfibios. En el presente estudio, utilizamos el anfibio Lithobates vibicarius del bosque montano de Costa Rica, que ahora parece persistir a pesar de la continua exposición al Bd, como organismo modelo experimental. Utilizamos la secuenciación de amplicones de ARNr 16S para investigar el efecto del clorotalonil en el microbioma de la piel de los renacuajos. Descubrimos que la exposición al clorotalonil cambia la composición de la comunidad bacteriana, con cambios más significativos a mayor concentración. También descubrimos que se reducía un mayor número de bacterias en la piel de los renacuajos cuando se exponían a la concentración más alta de clorotalonil. Detectamos la supresión de cuatro bacterias presuntamente inhibidoras de Bd en los renacuajos expuestos al fungicida. Nuestros resultados sugieren que la exposición a un fungicida ampliamente utilizado podría estar afectando a las comunidades bacterianas asociadas al hospedador, lo que podría alterar un rasgo protector de los anfibios frente a los patógenos.

Palabras Clave

clorotalonil; plaguicida; anfibio; microbioma cutáneo; comunidades bacterianas

The skin microbiome is an important part of amphibian immune defenses and protects against pathogens such as the chytrid fungus Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), which causes the skin disease chytridiomycosis. Alteration of the microbiome by anthropogenic factors, like pesticides, can impact this protective trait, disrupting its functionality. Chlorothalonil is a widely used fungicide that has been recognized as having an impact on amphibians, but so far, no studies have investigated its effects on amphibian microbial communities. In the present study, we used the amphibian Lithobates vibicarius from the montane forest of Costa Rica, which now appears to persist despite ongoing Bd-exposure, as an experimental model organism. We used 16S rRNA amplicon sequencing to investigate the effect of chlorothalonil on tadpoles’ skin microbiome. We found that exposure to chlorothalonil changes bacterial community composition, with more significant changes at a higher concentration. We also found that a larger number of bacteria were reduced on tadpoles’ skin when exposed to the higher concentration of chlorothalonil. We detected four presumed Bd-inhibitory bacteria being suppressed on tadpoles exposed to the fungicide. Our results suggest that exposure to a widely used fungicide could be impacting host-associated bacterial communities, potentially disrupting an amphibian protective trait against pathogens.

Keywords

chlorothalonil; pesticide; amphibian; skin microbiome; bacterial communities

Nombre de revista NA

Año de publicación 2023

Número NA

Volumen NA

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Autorización No

Proyecto 1214

En la actualidad, la actividad piñera en Costa Rica tiene una alta relevancia debido al impacto que representa a nivel económico, social y ambiental. Hoy por hoy, se ha extendido una gran preocupación sobre el impacto negativo causado por los residuos lignocelulósicos a nivel medioambiental, esto pues dichos residuos no han logrado ser integrados a algún proceso para convertirlos en productos con mayor valor agregado. De esta forma, el proyecto buscó generar una alternativa para el manejo de residuos de piña, mediante la aplicación biotecnológica de las propiedades degradadoras de microorganismos, en este caso, el potencial enzimático de la especie de hongos Ganoderma sp. Con esto, se establece el objetivo de determinar las condiciones óptimas de una fermentación en estado líquido para la producción de enzimas con el potencial para la degradación de rastrojos de piña. Lo anterior explora una forma de integrar los residuos de la actividad piñera en Costa Rica (rastrojos) a un proceso de economía circular con el fin de obtener un producto con valor agregado. Para obtener la mayor actividad enzimática se requirió el uso de un medio bajo en nutrientes, con un pH ácido y sin suplementos de fibras de piña, además se observó que la mayor actividad enzimática se dio el día 12 de la totalidad de incubación de análisis.

Palabras Clave

Lacasas, Manganeso peroxidasa, Ganoderma sp., hongo de pudrición blanca, degradación lignocelulósica

Currently, the pineapple activity in Costa Rica is highly relevant due to its economic, social and environmental impact. Today, there is widespread concern about the negative impact caused by lignocellulosic residues on the environment, as these residues have not been integrated into any process to convert them into products with greater added value. Thus, the project sought to generate an alternative for the management of pineapple residues, through the biotechnological application of the degrading properties of microorganisms, in this case, the enzymatic potential of the fungi species Ganoderma sp. With this, the objective was established to determine the optimal conditions of a fermentation in liquid state for the production of enzymes with the potential for the degradation of pineapple stubble. This explores a way to integrate the residues of the pineapple activity in Costa Rica (stubble) to a circular economy process in order to obtain a value-added product. To obtain the highest enzymatic activity, the use of a medium low in nutrients, with an acid pH and without pineapple fiber supplements was required, and it was observed that the highest enzymatic activity occurred on day 12 of the total incubation period.

Keywords

Laccase, Manganese peroxidase, Ganoderma sp., white rot fungus, lignocellulose degradation

Nombre de revista NA

Año de publicación 2023

Número 1

Volumen NA

Página pagina

Autorización No

Proyecto 1214

NA

Palabras Clave

NA

NA

Keywords

NA

Nombre de revista Chemoecology

Año de publicación 2022

Número 32

Volumen 32

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Autorización No

Proyecto 743

La secreción de la glándula odorífera de una especie no determinada de Prionostemma de Costa Rica fue analizada por cromatografía de gases– espectrometría de masas y se ha demostrado que consiste en ácidos carboxílicos de cadena media (principalmente ácido octanoico) y un ß-hidroxicarboxílico ácido, finalmente identificado como mirmicacina (= ácido (R)-3-hidroxidecanoico). Mientras que las secreciones de las glándulas odoríferas en los recolectores han sido considerados tradicionalmente como productos de la síntesis de novo, aquí proporcionamos evidencia de la inusual caso de constituyentes de glándulas odoríferas derivados del secuestro: al menos la mirmicacina parece haber sido secuestrada de las hormigas cortadoras de hojas que constituyen una parte de las presas de las especies de Prionostemma aquí investigadas. Este es el primer informe sobre la glándula odorífera. química de la subfamilia Gagrellinae de esclerosomátidos, así como sobre un posible mecanismo de secuestro en recolectores.

Palabras Clave

Opiliones Quimiosistemática 3-Hydroxydecanoic acid defensas químicas Eupnoi Palpatores

The scent gland secretion of an undetermined species of Prionostemma from Costa Rica was analyzed by gas chromatography– mass spectrometry and shown to consist of medium-chain carboxylic acids (mainly octanoic acid) and a ß-hydroxycarboxylic acid, eventually identified as myrmicacin (= (R)-3-hydroxydecanoic acid). While scent gland secretions in harvestmen have traditionally been considered to be products of de novo synthesis, we here provide evidence for the unusual case of sequestration-derived scent gland constituents: at least myrmicacin appears to be sequestered from leaf-cutter ants that constitute a part of the prey of the Prionostemma-species herein investigated. This is the first report on the scent gland chemistry of the sclerosomatid subfamily Gagrellinae as well as on a possible sequestration mechanism in harvestmen.

Keywords

Harvestmen · Chemosystematics · 3-Hydroxydecanoic acid · Chemical defense · Eupnoi · Palpatores

Nombre de revista Animal Behaviour

Año de publicación 2016

Número 116

Volumen 116

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Autorización No

Proyecto 1020

La capacidad de reconocer parientes es importante. Puede permitir que los animales favorezcan a sus parientes cercanos en comportamientos de afiliación y también que eviten la endogamia. Aunque la presencia y los efectos del reconocimiento de parientes han sido ampliamente estudiados, se conoce poco sobre el proceso por el cual este se desarrolla. Aquí investigamos potenciales señales que los monos cariblancos, Cebus capucinus, podrían utilizar para detectar a sus medios hermanos y parientes más cercanos. Nos centramos en el primer año de vida en una muestra de 130 monos infantes de la población Lomas Barbudal en Costa Rica. Mostramos que (1) la relación con machos emparentados a nivel de medios hermanos o más cercanos se pueden predecir por el estatus de dominancia de los machos, el tiempo que pasan en proximidad de un macho, y la cercanía de edad; y (2) que la relación de parentesco con hembras a nivel de medios hermanos o superior puede ser predicha por el tiempo pasado en proximidad de una hembra (pero no por la cercanía de edad). La identidad de los padres es predicha por el estatus de dominancia de los machos y por la cantidad de tiempo que los infantes pasan cerca de los machos. La cercanía en edad (pero no el tiempo en cercanía de otro mono) predice la relación de hermanos paternos. Estos resultados demuestran que los monos juveniles tienen acceso a información para reconocer parientes cercanos. Futuras investigaciones son necesarias para determinar si los monos usan estas señales más tarde en la vida, cuando son adultos.

Palabras Clave

proximidad de edad, mono capuchino, familiaridad social temprana, reconocimiento de parentesco, dominación masculina

The ability to recognize kin has important impacts on fitness because it can allow for kin-biased affiliative behaviours and avoidance of mating with close kin. While the presence and effects of kin biases have been widely studied, less is known about the process by which animals recognize close kin. Here we investigate potential cues that white-faced capuchin monkeys, Cebus capucinus, may use to detect half siblings and closer kin. We focus on the first year of life in a sample of 130 infant (N ¼ 65 infant females) wild capuchins from the Lomas Barbudal population in Costa Rica.We show that (1) infant relatedness to juvenile and adult males at the level of half sibling and higher can be predicted by male alpha status, spatial proximity and age proximity, and that (2) infant relatedness to juvenile and adult females at the level of half sibling or higher can be predicted by spatial proximity (but not age proximity). Furthermore, (1) the identities of infants' fathers can also be predicted by male alpha status and the spatial proximity between infants and adult males, and (2) age proximity (but not spatial proximity) is predictive of paternal sibship. These results suggest that infant capuchins have access to multiple cues to close relatedness and paternal kinship, although whether infants use these cues later in life remains to be explored in future research.

Keywords

age proximity, capuchin, early social familiarity, kin recognition, male dominance

Nombre de revista Behavioral Ecology and Sociobiology

Año de publicación 2016

Número 70

Volumen 70

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Autorización No

Proyecto 1020

La documentación de la endogamia y sus posibles costos en las poblaciones silvestres es un asunto complicado. La muerte infantil previa a la colección de muestras genéticas limita la capacidad de los investigadores para medir los costos físicos de la endogamia, y la información sobre el linaje de los individuos es necesaria para estimar con precisión la relación de parentesco entre pares de individuos. Utilizando datos colectados a lo largo de 25 años de investigación del Proyecto de Monos Lomas Barbudal, y muestras de 109 hembras que han dado a luz, encontramos que, a pesar de la frecuente co-residencia, los monos cariblancos producen descendencia con parientes cercanos (emparentados a un nivel de medio hermano o más alto) con menos frecuencia de lo esperado. También encontramos evidencia de costos físicos entre los animales consanguíneos manifestados en el retraso de la edad al primer parto. Se necesita más investigación para determinar los mecanismos por los cuales los individuos desarrollan aversión sexual hacia sus parientes.

Palabras Clave

evitación de la endogamia, depresión endogámica, Primates, monos capuchinos

Documenting inbreeding and its potential costs in wild populations is a complicated matter. Early infant death before genetic samples can be collected limits the ability of researchers to measure fitness costs, and pedigree information is necessary to accurately estimate relatedness between breeding individuals. Using data from 25 years of research from the Lomas Barbudal Capuchin Monkey Project, and a sample of 109 females that have given birth, we find that despite frequent co-residency of adult opposite-sexed individuals, capuchins produce offspring with close kin (i.e., related at the halfsibling level or higher) less often than would be expected in the absence of inbreeding avoidance. We do not find support for alternative, non-behavioral explanations for this pattern and thus argue for mate choice. Furthermore, we find evidence for fitness costs among inbred animals in the form of delayed female age at first birth but not significantly higher juvenilemortality. Further research is necessary in order to determine the mechanisms by which individuals develop sexual aversion to close kin. Through a combination of demographic records, maternal pedigrees, and genetically determined paternity, this study provides a detailed study of inbreeding and inbreeding avoidance in a well-studied mammal population. This study provides (1) evidence that capuchin monkeys avoid mating with close kin at both the level of parent-offspring and half sibling and (2) evidence of fitness costs to inbreeding in the form of delayed first age at reproduction.

Keywords

Inbreeding avoidance, Inbreeding depression, Primates, Capuchin monkeys

Nombre de revista Behaviour

Año de publicación 2017

Número 2

Volumen 154

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Autorización No

Proyecto 1020

Padres e hijos tienen un vínculo social muy fuerte. Cuando un macho alfa mantiene el estatus de alfa de la manada por muchos años, sus hijos adultos lo apoyan en coaliciones agresivas, ayudándole a prevenir la invasión de machos de otras manadas. Los machos emigran de su manada natal a una mayor edad si sus padres viven con ellos más tiempo. Los machos son más propensos a retrasar la emigración natal si son más extrovertidos, más neuróticos, si sus padres co-residen más tiempo con ellos, y si hay pocos cambios de macho alfa. A veces, cuando sus padres son vencido por machos que llegan de afuera, los padres y hijos emigran juntos para buscar otra hogar. Aunque la co-residencia de padres con hijos predice la edad de emigración desde la manada natal, no predice la edad a la que machos alcanzan a ser jefes de una manada. Los machos más extrovertidos alcanzan el estado alfa mas temprano en la vida.

Palabras Clave

historias de vida de machos, personalidad, dispersión, rango de dominancia, monos capuchinos

It is rare in studies of long-lived animals to know enough about the personalities and early experiences of individuals to use this information to predict their behaviour during major life transitions in adolescence and adulthood. Here, we examine how personality traits and early experiences predict age of natal emigration and timing of first ascent to alpha status in 169 wild male white-faced capuchins studied at Lomas Barbudal, Costa Rica, 75 of whom emigrated and 23 of whom acquired alpha status. Males were more likely to delay natal emigration if they were more extraverted, more neurotic, if their fathers co-resided longer with them, and if there were fewer alpha male turnovers. More extraverted males attained alpha status sooner.

Keywords

male life histories, personality, dispersal, dominance rank, capuchins

Nombre de revista MBio

Año de publicación 2021

Número 6

Volumen 12

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Autorización No

Proyecto 994

La dieta y los microbiomas intestinales están estrechamente relacionados tanto a corto como a largo plazo. Los cambios en la dieta pueden alterar el microbioma, mientras que los microbios, a su vez, permiten a los huéspedes acceder a dietas novedosas. Las abejas son avispas que cambiaron a un estilo de vida vegetariano y la gran mayoría de las abejas se alimentan de polen y néctar. Sin embargo, algunas especies de abejas sin aguijón también recolectan carroña, y algunas han vuelto por completo a un estilo de vida necrófago, dependiendo de la carroña para obtener proteínas y sin visitar flores. Estas abejas "buitre" pertenecen al clado de ápidos corbiculados, conocido por su antigua asociación con un pequeño grupo de filotipos microbianos centrales. Aquí investigamos el microbioma de la abeja buitre, junto con especies facultativamente necrófagas y polinívoras obligadas estrechamente relacionadas, para comprender cómo estas dietas interactúan con la estructura del microbioma. A través de una secuenciación profunda del gen 16S rRNA y análisis comunitarios posteriores, encontramos que las abejas buitre perdieron algunos microbios centrales, retuvieron otros y entraron en asociaciones novedosas con microbios acidófilos que se encuentran en el medio ambiente y en la carroña. La abundancia de bacterias acidófilas sugiere que un intestino ácido es importante para la nutrición y la salud de las abejas buitre, como se ha encontrado en otros animales que se alimentan de carroña. Las abejas necrófagas facultativas tienen microbiomas más variables que las abejas estrictamente polinívoras, lo que sugiere que la dieta de las abejas puede interactuar con los microbiomas tanto a corto como a largo plazo. Un estudio más detallado de las abejas buitre promete proporcionar información valiosa sobre el papel del microbioma en los cambios extremos de dieta.

Palabras Clave

microbioma de abejas apidae corbiculadas, carroña, necrofagia, cambio de dieta, ecología de los polinizadores

Diet and gut microbiomes are intricately linked on both short and long timescales. Changes in diet can alter the microbiome, while microbes in turn allow hosts to access novel diets. Bees are wasps that switched to a vegetarian lifestyle, and the vast majority of bees feed on pollen and nectar. Some stingless bee species, however, also collect carrion, and a few have fully reverted to a necrophagous lifestyle, relying on carrion for protein and forgoing flower visitation altogether. These “vulture” bees belong to the corbiculate apid clade, which is known for its ancient association with a small group of core microbiome phylotypes. Here, we investigate the vulture bee microbiome, along with closely related facultatively necrophagous and obligately pollinivorous species, to understand how these diets interact with microbiome structure. Via deep sequencing of the 16S rRNA gene and subsequent community analyses, we find that vulture bees have lost some core microbes, retained others, and entered into novel associations with acidophilic microbes found in the environment and on carrion. The abundance of acidophilic bacteria suggests that an acidic gut is important for vulture bee nutrition and health, as has been found in other carrion-feeding animals. Facultatively necrophagous bees have more variable microbiomes than strictly pollinivorous bees, suggesting that bee diet may interact with microbiomes on both short and long timescales. Further study of vulture bees promises to provide rich insights into the role of the microbiome in extreme diet switches.

Keywords

corbiculate apid core microbiome, carrion, necrophagy, diet switch, pollinator ecology